疯狂位图之——位图实现12GB无重复大整数集排序
《Programming Pearls》(编程珠玑)第一章讲述了如何用位图排序无重复的数据集,整个思想很简洁,今天实践了下。
一、主要思想
位图排序的思想就是在内存中申请一块连续的空间作为位图,初始时将位图的每一位都置为0,然后依次读取待排序文件的整数,将整数所在的位设置为1,最后扫描位图,如果某一位为1,则说明这个数存在,输出到已排序文件。比如待排序的数据S={3,0,4,1,7,2,5},max(S)=7,我们可以设置一个八位的位图B,将位图的每一位初始为0,即B=[0,0,0,0,0,0,0,0],对S中的每一个整数d,设置B[d]=1,即B=[1,1,1,1,1,1,0,1],最后扫描位图,对位图的每一位i,如果B[i]==1,则输出i到已排序文件,排序后的S={0,1,2,3,4,5,7}。
整个过程只需要遍历一遍待排序文件和位图,时间复杂度O(n),需要的辅助空间为(max(S)/8)B。虽然这个排序算法只能在无重复的整数集上运行,但对于有些需求,确实做到高效实现,比如说给手机号码排序,手机号码11位,第一位始终为1,理论上可以有10^10个号码,但一些号码未发放,即有些号码在系统中不存在,假设系统中有50%的合法号码,每个号码用long int表示,这么多号码所需要的空间为50%*(10^10)*4B=20GB,不能放在内存中进行快速排序。一个可选的方案是分多趟进行归并排序,但需要较长的时间。我们申请一个10^10位的位图,需要的内存是10^10/8B=1.25GB,完全可以在当代的PC机上运行,在扫描位图时,假设某一位i为1,输出文件时,在前面添加一个1,例如i=3885201314,输出为13885201314。
二、算法实现
用c语言实现的话,需要自己封装位图操作,这里需要用到三个操作:设置位图的所有位为0(setAllZero);设定指定的位为1(setOne);查看指定的位是否为1(find);代码如下:
1 #include <malloc.h> 2 #include <stdlib.h> 3 #include <stdio.h> 4 #include <time.h> 5 #include <math.h> 6 7 #define MAX_NUM 16777216//最大的数,也就是需要的位 8 #define BYTE_NUM (1+MAX_NUM/8)//字节数 9 #define MASK 0x07 10 11 void setAllZero(unsigned char *p,long size); 12 void setOne(unsigned char *p,long loc); 13 int find(unsigned char *p,long loc); 14 bool getSorted(unsigned char *bitmap,char *fileName); 15 bool setBitmap(unsigned char *bitmap,char *fileName); 16 int bitmapSort(); 17 int main(){ 18 return bitmapSort(); 19 } 20 int bitmapSort(){ 21 unsigned char *bitmap; //位图指针 22 bitmap = (unsigned char *)malloc(BYTE_NUM*sizeof(unsigned char)); 23 if(bitmap == NULL){ 24 printf("Malloc failed\n"); 25 return -1; 26 } 27 setAllZero(bitmap,BYTE_NUM);//将位图所有位设置为0 28 setBitmap(bitmap,"phoneNumber.txt");//扫描待排文件,将位图对应位设置为1 29 getSorted(bitmap,"bitmapSort.txt"); //扫描位图,将位图为1的位号输出到文件 30 free(bitmap);//释放位图 31 return 0; 32 } 33 /***********设置待排序数据的位图**************/ 34 bool setBitmap(unsigned char *bitmap,char *fileName){ 35 FILE *readFp; 36 printf("Setting bitmap...\n"); 37 readFp = fopen(fileName,"r"); 38 if(readFp == NULL) 39 return false; 40 long phoneNum=0; 41 while(fscanf(readFp,"%ld\n",&phoneNum) != EOF){ 42 setOne(bitmap,phoneNum);//将 phoneNum位设置为1 43 } 44 fclose(readFp); 45 return true; 46 } 47 /*****顺序遍历位图输出记录,从而实现排序****************/ 48 bool getSorted(unsigned char *bitmap,char *fileName){ 49 printf("Search bitmap...\n"); 50 FILE *writeFp; 51 writeFp = fopen(fileName,"w"); 52 if(writeFp == NULL) 53 return false; 54 long phoneNum=0; 55 for(phoneNum = 0; phoneNum < MAX_NUM; phoneNum += 1){ 56 if(find(bitmap,phoneNum)){ 57 fprintf(writeFp,"%ld\n",phoneNum); 58 } 59 } 60 fclose(writeFp); 61 return true; 62 } 63 /******先将位图清零********/ 64 void setAllZero(unsigned char *bitmap,long size){ 65 for(long i=0;i<size;i++) 66 *(bitmap+i) &= 0; 67 } 68 /************************************************* 69 将指定的位置为1 70 (loc>>3)相当于整除2^3=8,即定位到字节数,MASK=0x07,loc&MASK相当于loc%8 71 ***************************************************/ 72 void setOne(unsigned char *bitmap,long loc){ 73 *(bitmap+(loc>>3)) |= (1<<(loc&MASK));// 74 } 75 76 /******查找指定的位是否为1********/ 77 int find(unsigned char *bitmap,long loc){ 78 return ((*(bitmap+(loc>>3))) & (1<<(loc&MASK))) == (1<<(loc&MASK)); 79 }
C++的STL中有一个数据结构bitset,操作位图很方便。
1 #include <bitset> 2 #define MAX_NUM 4000000//最多的数,即需要的位数 3 using namespace std; 4 5 int main(){ 6 FILE *readFp,*writeFp; 7 readFp = fopen("phoneNumber1.txt","r"); 8 writeFp = fopen("bitsetSorted.txt","w"); 9 bitset<MAX_NUM> bitmap; 10 for(long i=0;i<MAX_NUM;i++){//先将位图初试化为0 11 bitmap.set(i,0); 12 } 13 printf("Begin set bitmap...\n"); 14 long number = 0; 15 while(fscanf(readFp,"%ld\n",&number) != EOF){ 16 bitmap.set(number,1);//将number所在位设置为1 17 } 18 printf("Begin search bitmap...\n"); 19 for(long i=0;i<MAX_NUM;i++){ 20 if(bitmap[i] == 1)//将位1的位输出到已排序文件 21 fprintf(writeFp,"%ld\n",number); 22 } 23 fclose(writeFp); 24 fclose(readFp); 25 }
排序算法很快就写好了,就开始生成测试数据,想生成0—2^31的乱序数据集还真不容易,首先要保证不重复,第二要丢掉40%的数(无效手机号码),第三要尽可能的乱序,捣了很久,最终还是找到了实现办法,生成了12GB的数据集,关于生成这个数据集的办法,欢迎一起讨论,我将会在下一篇中总结一下我的方法。
完整的代码可以参考github。
感谢关注,欢迎评论。
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