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fengchuiguo

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2017-03-21-各种资源数据库的简单罗列

1:水稻数据库: http://shigen.nig.ac.jp/rice/oryzabase/
2:已知蛋白uniref90:ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/uniref/uniref90/uniref90.fasta.gz
3:GO数据库:http://archive.geneontology.org/latest-full/
4:已知蛋白和GOid一一对应:ftp://ftp.pir.georgetown.edu/databases/idmapping/
5:UCSC的人类各类数据整合:http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenpath/hg38/database/

6:KEGG学习:http://www.bio-info-trainee.com/1188.html

7:使用R分析RNA-Seq:http://biocluster.ucr.edu/~rkaundal/workshops/R_mar2016/RNAseq.html#basic-workflows

8:GWAS补缺:https://www.genetics.ucla.edu/software/

9:已知蛋白质序列:ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/complete/uniprot_sprot.fasta.gz

10:UCSC各种数据格式介绍:http://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQformat#format1

11: UCSC各种文件格式转换脚本:http://hgdownload.soe.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/

posted @ 2017-03-21 11:36  fengchuiguo  阅读(164)  评论(0)    收藏  举报
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