(数据科学学习手札18)二次判别分析的原理简介&Python与R实现
上一篇我们介绍了Fisher线性判别分析的原理及实现,而在判别分析中还有一个很重要的分支叫做二次判别,本文就对二次判别进行介绍:
二次判别属于距离判别法中的内容,以两总体距离判别法为例,对总体G1,,G2,当他们各自的协方差矩阵Σ1,Σ2不相等时,判别函数因为表达式不可化简而不再是线性的而是二次的,这时使用的构造二次判别函数进行判别类别的方法叫做二次判别法,下面分别在R和Python中实现二次判别:
R
在R中,常用的二次判别函数qda(formula,data)集成在MASS包中,其中formula形式为G~x1+x2+x3,G表示类别变量所在列的名称,~右端连接的累加式表示用来作为特征变量的元素对应的列名称,data为包含前面所述各变量的数据框,下面对鸢尾花数据进行二次判别,这里因为样本量较小,故采用bootstrap自助法进行抽样以扩充训练集与验证集,具体过程如下:
rm(list=ls()) library(MASS) #挂载鸢尾花数据 data(iris) data <- iris #bootstrap法产生训练集 sam <- sample(1:length(data[,1]),10000,replace = T) train_data <- data[sam,] #bootstrap法产生测试集 sam <- sample(1:length(data[,1]),2000,replace = T) test_data <- data[sam,] #训练二次判别模型 qd <- qda(Species~.,data=train_data) #保存预测结果 pr <- predict(qd,test_data[,1:4]) #打印混淆矩阵 (tab <- table(test_data[,5],pr$class)) #打印分类正确率 cat('正确率:',sum(diag(tab))/length(test_data[,1]))
分类结果如下:
Python
这里和前一篇线性判别相似,我们使用sklearn包中的discriminant_analysis.QuadraticDiscriminantAnalysis来进行二次判别,依旧是对鸢尾花数据进行分类,这里和前一篇一样采用留出法分割训练集与验证集,具体代码如下:
'''Fisher线性判别分析''' import numpy as np from sklearn import datasets from sklearn.discriminant_analysis import QuadraticDiscriminantAnalysis from sklearn.model_selection import train_test_split iris = datasets.load_iris() X = iris.data y = iris.target '''二次判别器''' '''利用sklearn自带的样本集划分方法进行分类,这里选择训练集测试集73开''' X_train,X_test,y_train,y_test = train_test_split(X,y,test_size=0.3) '''搭建LDA模型''' qda = QuadraticDiscriminantAnalysis() '''利用分割好的训练集进行模型训练并对测试集进行预测''' qd = qda.fit(X_train,y_train).predict(X_test) '''比较预测结果与真实分类结果''' print(np.array([qd,y_test])) '''打印正确率''' print('正确率:',str(round(qda.score(X_test,y_test),2)))
以上就是关于二次判别的简要内容,如有笔误之处望指出。