常用网站总结

 

肿瘤研究领域最常用的数据库资源

 

　　1、COSMIC：

　　　　https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic/browse/tissue?hn=carcinoma&in=t&sn=thyroid&ss=all

　　　　主要记录与人类各种类型癌症相关的体细胞突变信息，这个数据库对于突变位点的信息记　　录较为详细，包括文献出处、样品名称、组织类型、涉及到的癌症种类和具体的突变内容，这个库既

　　　　有对某一基因突变现象的综合统计，也有对针对某一肿瘤组织或癌症细胞系的所有突变信息统计。这个数据库对学术是免费的，但是商业用途需要支付一定的费用。

　　此网站的使用指南：http://www.php230.com/1494108961.html

　　2、ClinVar

　　　　http://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/　

　　3、HGMD

　　　　http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php

　　　　人类基因突变数据库。从1996年开始，由英国Cardiff的医学遗传研究所维护，来源主要是文献上的由遗传所引起的疾病的种系变异。两年前的版本是免费的，但是有近两年的更新的版本需要收费。

　　4、OMIM

　　　　官网链接：http://www.omim.org/

　　　　在线人类孟德尔遗传信息，从1960年开始，由约翰霍普金斯大学医学院的研究人员维护，有2万左右的人类基因和遗传疾病的详细目录。OMIM包含了支持基因与疾病关系和疾病机理的代表性基因变异。也是免费的。

　　5、The Cancer Genome Atlas （TCGA）

　　官网链接：http://cancergenome.nih.gov/

　　由美国国立癌症研究所和国家人类基因组研究所（National Human Genome Research Institute，NHGRI）资助，关注与癌症的发生和发展相关的分子突变图谱。

 

上面几个是最常用的，其实类似的数据库还有很多，它们各有侧重，参考《肿瘤生物信息学数据库》里面的资料，以下列表你一定用得上：

 

 

 

疾病致病SNP位点查找：

　　1、GCBI

　　2、Springer link

　　3、OPENi

　　4、Pubmed

　　5\SCI-HUB 

　　6、