建议使用外部的TOMCAT，这样报错的信息会清楚很多（我的一个web应用使用MyEclipse内部的TOMCAT总存在问题，使用外部安装的TOMCAT就好了）。
配置过程如下：
1、运行MyEclipse，打开Window/Preferences安装JDk，Java->Installed JREs下添加JDK，建立JRE名称为JDK，之后到JRE路径下选择Java目录（包含JDK和JRE文件夹）下的JDK文件夹。
2、启动MyEclipse6.5.0 GA，Window/Preferences/Myeclipse Enterprise Workbench->Servers->Tomcat->Tomcat 6.x下选择TOMCAT为Enable，选择TOMCAT子目录的路径，下面的Base Directory和Temp Directory路径自动生成。并置JDK为刚才配置的JDK选项。
注意：TOMCAT里面的JDK是对应Java->Installed JREs选项中的JDK，出现问题可能是该JDK路径指向了JREHOME，而不是JAVAHOME。
推荐文章：Eclpise下配置MyEclipse的TOMCAT（图解），http://blog.donews.com/coris/archive/2006/03/17/772830.aspx
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