摘要: 本地KEGG功能注释工具 https://www.genome.jp/tools/kofamkoala/ 1.下载数据库软件 wget -bc ftp://ftp.genome.jp/pub/db/kofam/ko_list.gz wget -bc ftp://ftp.genome.jp/pub/d 阅读全文
posted @ 2020-10-16 12:15 萃英山下 阅读(484) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: wget -bc https://www.dfam.org/releases/Dfam_3.2/families/Dfam.h5.gz --2020-10-15 22:11:24-- https://www.dfam.org/releases/Dfam_3.2/families/Dfam.h5.gz 阅读全文
posted @ 2020-10-15 22:21 萃英山下 阅读(282) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: git clone https://github.com/Gaius-Augustus/Augustus.git cd Augustus 1.bam2hints compile error vim auxprogs/bam2hints/Makefile # Variable definitionBA 阅读全文
posted @ 2020-10-15 14:23 萃英山下 阅读(416) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: git clone https://github.com/pezmaster31/bamtools.gitcd bamtoolsCMakeLists.txt docs LICENSE README src tests tools mkdir build cd build cmake -DCMAKE_ 阅读全文
posted @ 2020-10-14 20:53 萃英山下 阅读(634) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: https://stackoverflow.com/questions/13701347/force-the-origin-to-start-at-0 阅读全文
posted @ 2018-08-22 09:30 萃英山下 阅读(805) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1、以管理员身份运行R 2、安装installr模块:install.packages("installr") 3、载入:library("installr") 4、运行命令:updateR() 阅读全文
posted @ 2018-08-17 17:24 萃英山下 阅读(505) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Description range returns a vector containing the minimum and maximum of all the given arguments. 即返回一个向量,该向量包含给定参数的最大值和最小值。 Usage 用法: Arguments 参数 an 阅读全文
posted @ 2018-08-12 11:13 萃英山下 阅读(10220) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: #! /usr/bin/perluse strict;use warnings;use Bio::SeqIO;my $file=shift;my $fa=Bio::SeqIO->new(-file=>$file,-format=>'fasta');while(my $seq_obj=$fa->nex 阅读全文
posted @ 2018-08-12 09:31 萃英山下 阅读(554) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: #!/usr/bin/env perluse strict;use warnings; sub TranslateDNAFile(){ use Bio::SeqIO; (my $infile,my $outfile)=@_; my $in=Bio::SeqIO->new(-file=>"$infil 阅读全文
posted @ 2018-08-12 09:28 萃英山下 阅读(598) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: https://stackoverflow.com/questions/7651/how-do-i-remove-duplicate-items-from-an-array-in-perl 阅读全文
posted @ 2018-07-26 21:00 萃英山下 阅读(884) 评论(1) 推荐(0) 编辑