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摘要: 信息熵 熵定义为信息的期望,某个待分类事物可以划分为多个类别,其中类别的信息为(为的概率): 熵为所有类别的信息期望值: 交叉熵 交叉熵误差: 为实际的分类结果, 为预测的结果,( 并且 ) 交叉熵误差 它有三个很好的性质: 1. 它可以真实的反应出真实分类结果和预测结果的误差 预测结果和真实分类结 阅读全文
posted @ 2023-10-10 19:59 emanlee 阅读(40) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: https://blog.csdn.net/weixin_43569478/article/details/111602670 bedtools是区间操作最常用的软件,pybedtools对其进行了封装,可以在python编程环境中灵活使用bedtools,而且进一步拓展出了很多有用的功能。在pyb 阅读全文
posted @ 2023-10-10 19:59 emanlee 阅读(58) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 梯度消失和梯度爆炸 2 神经网络梯度消失与梯度爆炸 2.1 简介梯度消失与梯度爆炸 层数比较多的神经网络模型在训练的时候会出现梯度消失(gradient vanishing problem)和梯度爆炸(gradient exploding problem)问题。梯度消失问题和梯度爆炸问题一般会随着网 阅读全文
posted @ 2023-10-10 19:59 emanlee 阅读(2297) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 2015年深度学习领域非常棒的一篇文献:《Batch Normalization: Accelerating Deep Network Training by Reducing Internal Covariate Shift》,这个算法目前已经被大量的应用,最新的文献算法很多都会引用这个算法,进行 阅读全文
posted @ 2023-10-10 19:59 emanlee 阅读(61) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: NotImplementedError Traceback (most recent call last) Cell In[10], line 5 3 s = pybedtools.BedTool(args.starrseq[0]).filter(lambda x: float(x[9]) > 1. 阅读全文
posted @ 2023-10-10 19:58 emanlee 阅读(174) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: pip install jupyter_contrib_nbextensions jupyter contrib nbextension install --user jupyter nbextension enable execute_time/Exec pip install jupyter_n 阅读全文
posted @ 2023-10-10 19:58 emanlee 阅读(461) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ERROR: Could not install packages due to an OSError: [Errno 2] 没有那个文件或目录: '/home/software/anaconda3/envs/mydlenv/lib/python3.8/site-packages/fastjsons 阅读全文
posted @ 2023-10-10 19:57 emanlee 阅读(143) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ImportError: cannot import name 'write_connection_file' from 'jupyter_client' (/home/software/anaconda3/envs/mydlenv/lib/python3.8/site-packages/jupyt 阅读全文
posted @ 2023-10-10 19:57 emanlee 阅读(404) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: jupyter, jupyter notebook, python, virtual-env, kernal 这些之间的各种关系是什么?为什么启动 jupyter notebook 会调用特别复杂? Jupyter(Lab/Server/Notebook) “dynamically” creates 阅读全文
posted @ 2023-10-10 19:57 emanlee 阅读(96) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: pybigwig 安装和使用 pyBigWig是用C编写的调用libBigWig库的python扩展,可以快速访问和处理bigBed和bigWig文件。 安装 pip install pybigwig 调用 import pyBigWig 读取和写入文件 pyBigWig.open #本地文件 bw 阅读全文
posted @ 2023-10-10 19:57 emanlee 阅读(319) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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