摘要： apt-get: debian系系统的软件包管理程序(其图形化前端就是大名鼎鼎的新立得了),会自动帮你搞定依赖关系 最常用参数: update —-与你的软件源(在/etc/apt/sources.list中列出)更新软件包列表,换源后需要执行 upgrade —-根据update得到的源软件库与本地已经安装的对比,(如果需要升级就)全部升级 ... 阅读全文

摘要： Perltidy is a Perl script which indents and reformats Perl scripts to make them easier to read. If you write Perl scripts, or spend much time reading 阅读全文

摘要： 在win 2003企业版操作系统下，卸载Oracle 9i ： 1.停止所有Oracle服务：在控制面板 -> 管理工具 -> 服务 -> 停止所有 oracle 服务 2.卸载程序：在开始菜单选择oracle的 Universal Installer选项 卸载所有oracle 产品（Universal Installer本身不能被删除） 或者：找到oracle 9i的安... 阅读全文

摘要： 一、安装telnet软件包(通常要两个） 1、 telnet-client (或 telnet)，这个软件包提供的是 telnet 客户端程序； 2、 telnet-server ，这个软件包提供的是 telnet 服务器端程序； 安装之前先检测是否这些软件包已安装，方法如下： ... 阅读全文

摘要： Perl 中的正则表达式 正则表达式是 Perl 语言的一大特色，也是 Perl 程序中的一点难点，不过如果大家能够很好的掌握他，就可以轻易地用正则表达式来完成字符串处理的任务，当然在 CGI 程序设计中就更能得心应手了。下面我们列出一些正则表达式书写时的一些基本语法规则。 1 正则表达式的三种形式 阅读全文

摘要： Eclipse -- window -- preferences -- run/debug -- console -- Fixed with console，开启Fixed with console 阅读全文

摘要： $- 当前页可打印的行数,属于Perl格式系统的一部分 $! 根据上下文内容返回错误号或者错误串 $” 列表分隔符 $# 打印数字时默认的数字输出格式 $$ Perl解释器的进程ID $% 当前输出通道的当前页号 $& 与上个格式匹配的字符串 $( 当前进程的组ID $) 当前进程的有效组ID $* 阅读全文

摘要： getopts的使用问题 #!/usr/bin/perl #execute ABC.pl -s 999 -g -t use Getopt::Std; getopts('s:t:g:',\%opts); foreach my $key ( keys %opts){ print $key,"-->;", 阅读全文

摘要： megablast 采用贪婪式算法，速度较一般blast快，多用于数据量大且序列相似性较高的情况。megablast 参数说明./megablast --helpmegablast 2.2.11 arguments: -d Database [String] default = nr -i Query File [File In] -e Expectation value [Real] default = 10.0 -m alignment view options: 0 = pairwise, 1 = query-anchored showing i... 阅读全文

摘要： formatdb is an outdated software tool in molecular bioinformatics to format protein or nucleotide databases for BLAST. It has been replaced by the tool makeblastdb and the NCBI "strongly encourage[s]" users to stop using formatdb.The formatdb.exe program is part of the BLAST release, which 阅读全文