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摘要: 秩和检验方法最早是由维尔克松(Wilcoxon)提出,叫维尔克松两样本检验法。后来曼—惠特尼将其应用到两样本容量不等(n1不等于n2)的情况,因而又称为曼—惠特尼U检验。这种方法主要用于比较两个独立样本的差异。 1、假设中的等价问题 设有两个连续型总体, 它们的概率密度函数分别为: f1(x),f2(x)(均为未知) 已知f1(x) = f2(x − a),a为末知常数,要检验... 阅读全文
posted @ 2011-12-17 11:41 emanlee 阅读(29586) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 线性判别式分析(Linear Discriminant Analysis, LDA),也叫做Fisher线性判别(Fisher Linear Discriminant ,FLD),是模式识别的经典算法,它是在1996年由Belhumeur引入模式识别和人工智能领域的。线性判别式分析的基本思想是将高维的模式样本投影到最佳鉴别矢量空间,以达到抽取分类信息和压缩特征空间维数的效果,投影后保证模式样本在新... 阅读全文
posted @ 2011-12-16 23:00 emanlee 阅读(2010) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: TNM分期系统是目前国际上最为通用的肿瘤分期系统。首先由法国人Pierre Denoix于1943年至1952年间提出,后来美国癌症联合委员会(AJCC,American Joint Committee on Cancer)和国际抗癌联盟(UICC,Union for International Cancer Control)逐步开始建立国际性的分期标准,并于1968年正式出版了第1版《... 阅读全文
posted @ 2011-12-16 16:06 emanlee 阅读(4802) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 循环肿瘤细胞(circulating tumor cells,CTCs)是指自发或因诊疗操作由实体瘤或转移灶释放进入外周血循环的肿瘤细胞,是恶性肿瘤患者出现术后复发和远处转移的重要原因.近年来,随着检测技术的不断改进,CTCs检测作为一种新型的非侵入性诊断工具,在早期发现患者术后复发与远处转移、评估疗效与预后等方面的应用价值已成为临床研究的热点. Circulating tumor cells ... 阅读全文
posted @ 2011-12-16 15:49 emanlee 阅读(3160) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: The term k-mer (or x-mer where x can be virtually any consonant of choice) usually refers to a specific n-tuple or n-gram of nucleic acid or amino acid sequences that can be used to identify certain r... 阅读全文
posted @ 2011-12-15 22:24 emanlee 阅读(810) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 动物所piRNA的高精度预测算法研究获得突破 第二代测序技术又称作深度测序技术,应用到RNA上统称作RNA-seq或RNA测序,它已成为基因表达和转录组分析的重要手段。第二代转录组测序数据中含有大量不编码蛋白质的ncRNA序列,因为它们像宇宙中的暗物质一样难以识别和有重要功能,也被称为“基因组暗物质”。由于数据量巨大,保守性差,又有噪音干扰,这些“暗物质”的识别成为表观遗传学和调控网络研究的瓶... 阅读全文
posted @ 2011-12-15 22:22 emanlee 阅读(441) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 基因组印记是指来自父方和母方的等位基因在通过精子和卵子传递给子代时发生了修饰,使带有亲代印记的等位基因具有不同的表达特性,这种修饰常为DNA甲基化修饰,也包括组蛋白乙酰化、甲基化等修饰。在生殖细胞形成早期,来自父方和母方的印记将全部被消除,父方等位基因在精母细胞形成精子时产生新的甲基化模式,但在受精时这种甲基化模式还将发生改变;母方等位基因甲基化模式在卵子发生时形成,因此在受精前来自父方和母方的等... 阅读全文
posted @ 2011-12-15 12:01 emanlee 阅读(3229) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰,调节基因的表达和关闭,与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学的重要研究内容之一。 最常见的甲基化修饰有DNA甲基化和组蛋白甲基化。 DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达。研究证实,CpG二核苷酸中胞... 阅读全文
posted @ 2011-12-15 11:47 emanlee 阅读(3450) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 课题名称:研究多个基因间相互作用的频域方法 -------------------------------------------------------------------------------- 1. 课题的目的和意义 人类为了了解在分子水平上生物组织的功能,迫切地想知道基因表达的具体过程和内在机理。事实上,这是当今生物信息学中一个热门且具有挑战性的研究领域。基因表达... 阅读全文
posted @ 2011-12-14 22:20 emanlee 阅读(1705) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 德国多个研究机构的研究人员绘制了来自病人血液的miRNA表达谱,其中包括自体免疫疾病、癌症、心血管疾病以及慢性炎症患者。该研究成果发表在9月4日的《自然—方法学》(Nature Methods)在线版上。 在一项多中心研究中,研究人员对患病个体的454个血液样本进行芯片分析,确定了863个microRNA的表达谱,并利用实时定量PCR验证了此miRNA组(miRNome)。他们检测了所有疾病的... 阅读全文
posted @ 2011-12-10 20:59 emanlee 阅读(483) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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