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摘要: 著名的科学杂志《Nature》于1999年刊登了两位科学家D.D.Lee和H.S.Seung对数学中非负矩阵研究的突出成果。该文提出了一种新的矩阵分解思想――非负矩阵分解(Non-negative Matrix Factorization,NMF)算法,即NMF是在矩阵中所有元素均为非负数约束条件... 阅读全文
posted @ 2012-03-30 08:23 emanlee 阅读(4744) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1:右键点击任务栏,工具栏,勾选语言栏。如果没有,操作下边。 2:双击我的电脑,控制面板,语言和区域选项,语言,详细信息,语言栏,勾选在桌面显示语言栏,确定。如果没有,操作下边。 3:双击我的电脑,控制面板,语言和区域选项,语言,详细信息,已安装的服务(取消高级服务前的勾),点击键盘图标,添加,简体中文/美式键盘,确定。 阅读全文
posted @ 2012-03-23 21:32 emanlee 阅读(1674) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 为了查找某个研究领域的相关信息,生物学家往往要花费大量的时间,更糟糕的是,不同的生物学数据库可能会使用不同的术语,好比是一些方言一样,这让信息查找更加麻烦,尤其是使得机器查找无章可循。Gene Ontology就是为了解决这种问题而发起的一个项目。 Gene Ontology中最基本的概念是term。GO里面的每一个entry都有一个唯一的数字标记,形如GO:nnnnnnn,还有一个term名,... 阅读全文
posted @ 2012-03-19 20:54 emanlee 阅读(8134) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Similar to other algorithm, K-mean clustering has many weaknesses: 1 When the numbers of data are not so many, initial grouping will determine the cluster significantly. 当数据数量不是足够大时,初始化分组很大程度上决定... 阅读全文
posted @ 2012-03-06 11:52 emanlee 阅读(6021) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: psrinfo -v # 查看CPU信息mpstat # 可以列出多cpu负载的状态/usr/platform/`uname -i`/sbin/prtdiag1.查看磁盘空间(硬盘使用情况) df -hk 2.看内存(内存使用情况;慢) echo ::memstat | mdb -k Pa... 阅读全文
posted @ 2012-03-03 09:05 emanlee 阅读(14318) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1. 层次聚类 层次聚类算法与之前所讲的顺序聚类有很大不同,它不再产生单一聚类,而是产生一个聚类层次。说白了就是一棵层次树。介绍层次聚类之前,要先介绍一个概念——嵌套聚类。讲的简单点,聚类的嵌套与程序的嵌套一样,一个聚类中R1包含了另一个R2,那这就是R2嵌套在R1中,或者说是R1嵌套了R2。具体说怎么算嵌套呢?聚类R1={{x1,x2},{x3},{x4,x5}嵌套在聚类R2={{x1,x2,... 阅读全文
posted @ 2012-02-28 11:45 emanlee 阅读(21858) 评论(1) 推荐(1) 编辑
摘要: matlab程序代码优化,性能优化 Matlab是一种强大的计算工具,方便的矩阵运算与工具箱为编程人员提供了极大的便利。但是其性能的缺失使得处理一些大计算量问题时显得效率不高,matlab程序的优化应从几个方面展开: 1.矩阵提前分配空间,矩阵第一次使用之后避免改变矩阵的维数。 2.尽量使用矩阵运算,少使用循环。 3.调用多次的计算代码写成函数形式,而不是写在脚本程序中,因为M... 阅读全文
posted @ 2012-02-27 22:13 emanlee 阅读(1751) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 根据txt文档不同种类介绍不同的读取数据方法 一、纯数据文件(没有字母和中文,纯数字) 对于这种txt文档,从matalb中读取就简单多了 例如test.txt文件,内容为 17.901 -1.1111 33.045 17.891 -1.1286 33.045 17.884 -1.1345 33.045 可以在command window中输入load test.txt ,然后... 阅读全文
posted @ 2012-02-24 08:22 emanlee 阅读(116855) 评论(1) 推荐(2) 编辑
摘要: 马氏距离是由印度统计学家马哈拉诺比斯(P. C. Mahalanobis)提出的,表示数据的协方差距离。它是一种有效的计算两个未知样本集的相似度的方法。与欧式距离不同的是它考虑到各种特性之间的联系(例如:一条关于身高的信息会带来一条关于体重的信息,因为两者是有关联的),并且是尺度无关的(scale- 阅读全文
posted @ 2012-02-17 14:26 emanlee 阅读(3609) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 自回归模: 利用前期若干时刻的随机变量的线性组合来描述以后某时刻随机变量的线性回归模型。 向量自回归模型(简称VAR模型)是一种常用的计量经济模型,由克里斯托弗·西姆斯(Christopher Sims)提出。它是AR模型的推广。 http://zh.wikipedia.org/wiki/%E5%90%91%E9%87%8F%E8%87%AA%E5%9B%9E%E5%BD%92%E6%... 阅读全文
posted @ 2012-02-06 15:34 emanlee 阅读(1482) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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