摘要:
shell中的赋值和操作默认都是字符串处理。1)使用let(只能进行整数运算)var=1let "var+=1"echo $var输出结果为2 注意:a)let几乎支持所有的运算符b)方幂运算应使用“**”c)参数在表达式中直接访问,不必加$d)一般情况下算数表达式可以不加双引号,但是若表达式中有b... 阅读全文
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# 显示第xx行的第yy列的一个字符sed -n 'xx,xxp' file | awk '{print substr($0,yy,1);}'# 修改第xx行的第yy列的一个字符Chr,并保存为新文件awk -F "" 'BEGIN { OFS="" }{if(NR == xx) for(i=yy;... 阅读全文
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cat > sendmymail.sh#!/bin/bash/usr/sbin/sendmail -t To: abc@gmail.com Cc: abc@gmail.com ... 阅读全文
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变量说明:$$Shell本身的PID(ProcessID)$!Shell最后运行的后台Process的PID$?最后运行的命令的结束代码(返回值)$-使用Set命令设定的Flag一览$*所有参数列表。如"$*"用「"」括起来的情况、以"$1 $2 … $n"的形式输出所有参数。$@所有参数列表。如"... 阅读全文
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(1)#!/bin/bashwhile read linedo echo $linedone < file (2)#!/bin/bashcat file | while read linedo echo $linedone(3)for line in `cat file`do echo $line... 阅读全文
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bwa的使用需要两中输入文件: Reference genome data(fasta格式 .fa, .fasta, .fna) Short reads data (fastaq格式 .fastaq, .fq)step 1: 建立 Index根据reference genome data(e.g. ... 阅读全文
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samtools的说明文档:http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtml samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集。包含有许多命令。以下是常用命令的介绍 1. view view命令的主要功能是:将sam文件转换成bam文件;然后对b 阅读全文
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bwa的安装流程安装本软体总共需要完成以下两个软体的安装工作:1) BWA2) Samtools1.BWA的安装a.下载BWA (download from BWA Source Forge )http://bio-bwa.sourceforge.net/bwa.shtmlb.安装BWA$ tar ... 阅读全文
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0.以下在系统CentOS 6.3 x86_64上操作1.试图运行程序,提示"libc.so.6: version `GLIBC_2.14' not found",原因是系统的glibc版本太低,软件编译时使用了较高版本的glibc引起的:[ghui@StuOSbin]$pwd/var/VMdisk... 阅读全文
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.Web Browser Control – Specifying the IE Version http://www.west-wind.com/weblog/posts/2011/May/21/Web-Browser-Control-Specifying-the-IE-VersionI use ... 阅读全文