emanlee - 博客园

2020年9月1日

摘要： 1. 检查内核版本 yum info kernel -q 已安装的软件包名称：kernel架构：x86_64版本：3.10.0发布：862.el7大小：62 M源：installed来自源：anaconda简介： The Linux kernel网址：http://www.kerne 阅读全文

posted @ 2020-09-01 12:22 emanlee 阅读(6344) 评论(0) 推荐(0)

CentOS 卸载 python

posted @ 2020-09-01 09:39 emanlee 阅读(3040) 评论(0) 推荐(0)

2020年8月31日

clusterMaker (Cytoscape, MCL cluster) 网络聚类，网络划分子网路，子模块。

摘要： Cytoscape -- apps -- clusterMaker -- MCL cluster. MCL cluster的用法用途：网络聚类，网络划分子网路，子模块。安装插件：选中网络，然后做如下操作新网络会出现在新窗口中。阅读全文

posted @ 2020-08-31 10:45 emanlee 阅读(2774) 评论(2) 推荐(0)

2020年8月29日

Eigen

摘要： http://eigen.tuxfamily.org/index.php?title=Main_Page Eigen is a C++ template library for linear algebra: matrices, vectors, numerical solvers, and rel 阅读全文

posted @ 2020-08-29 21:43 emanlee 阅读(618) 评论(0) 推荐(0)

dask

摘要： https://pypi.org/project/dask/ [root@ibiomed lib-dynload]# pip install daskCollecting dask Downloading dask-2.25.0-py3-none-any.whl (834 kB) |████████ 阅读全文

posted @ 2020-08-29 21:39 emanlee 阅读(907) 评论(0) 推荐(0)

nanopolish 安装使用

摘要： https://github.com/jts/nanopolish nanopolish Software package for signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate a 阅读全文

posted @ 2020-08-29 21:21 emanlee 阅读(1480) 评论(0) 推荐(0)

h5py

摘要： HDF5 for Python h5py is a thin, pythonic wrapper around the HDF5, which runs on Python 3 (3.6+). Websites Main website: https://www.h5py.org Source co 阅读全文

posted @ 2020-08-29 21:18 emanlee 阅读(406) 评论(0) 推荐(0)

Sam2Tsv 安装使用

摘要：官网 http://lindenb.github.io/jvarkit/Sam2Tsv.html 下载安装 $ git clone "https://github.com/lindenb/jvarkit.git"$ cd jvarkit$ ./gradlew sam2tsv Example $ ja 阅读全文

posted @ 2020-08-29 21:13 emanlee 阅读(591) 评论(0) 推荐(0)

samtools 安装使用

摘要：官网： https://github.com/samtools/samtools https://github.com/samtools/samtools/releases https://github.com/samtools/samtools/blob/develop/INSTALL 安装： w 阅读全文

posted @ 2020-08-29 21:10 emanlee 阅读(2839) 评论(0) 推荐(0)

minimap2安装使用

摘要：官网： https://github.com/lh3/minimap2 https://github.com/lh3/minimap2/releases/tag/v2.17 Download and install: wget https://github.com/lh3/minimap2/rele 阅读全文

posted @ 2020-08-29 20:57 emanlee 阅读(5108) 评论(0) 推荐(0)