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摘要: 在下载库的界面点击 Manage Repositories 通过切换下载源就可以解决问题啦 常用pip的镜像路径有:1.阿里云 (经过测试,pip提示版本不正确)pip install 包名 -i http://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/2.中国科技大学 (经过测 阅读全文
posted @ 2020-02-24 17:16 emanlee 阅读(4549) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 在使用Pycharm编写程序时,我们时常需要调用某些模块,但有些模块事先是没有的,我们需要把模块添加上去。 我的PyCharm版本如下: 点击左上角的 File 文件 - Settings 子菜单 左侧找到 Project Interpreter, 右侧双击 pip 顶部输入想安装的模块,过一会在下 阅读全文
posted @ 2020-02-24 16:46 emanlee 阅读(2601) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 目录 MCMC(一)蒙特卡罗方法 https://www.cnblogs.com/emanlee/p/12356492.htmlMCMC(二)马尔科夫链 https://www.cnblogs.com/emanlee/p/12357341.htmlMCMC(三)MCMC采样和M-H采样 https: 阅读全文
posted @ 2020-02-24 16:06 emanlee 阅读(1063) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 目录 MCMC(一)蒙特卡罗方法 https://www.cnblogs.com/emanlee/p/12356492.htmlMCMC(二)马尔科夫链 https://www.cnblogs.com/emanlee/p/12357341.htmlMCMC(三)MCMC采样和M-H采样 https: 阅读全文
posted @ 2020-02-24 13:13 emanlee 阅读(1141) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 吉布斯采样的通俗解释 Gibbs Sampling 就是以一定的概率分布,看发生什么事件。 例子 甲只能 E:吃饭、学习、打球, 时间 T:上午、下午、晚上, 天气 W:晴朗、刮风、下雨。 现在要一个sample,这个sample可以是:打球+下午+晴朗。 问题是我们不知道 p(E,T,W),或者说 阅读全文
posted @ 2020-02-24 12:34 emanlee 阅读(910) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 简介 受限玻尔兹曼机是一种无监督,重构原始数据的一个简单的神经网络。 受限玻尔兹曼机先把输入转为可以表示它们的一系列输出;这些输出可以反向重构这些输入。通过前向和后向训练,训练好的网络能够提取出输入中最重要的特征。 为什么RBM很重要? 因为它能够自动地从输入中提取重要的特征。 RBM有什么用 用于 阅读全文
posted @ 2020-02-24 09:38 emanlee 阅读(2171) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 视频: DBN(深度置信网络) https://www.bilibili.com/video/av76305306/ 【一起啃书】深度学习入门(一) https://www.bilibili.com/video/av62840086/?spm_id_from=333.788.videocard.4 阅读全文
posted @ 2020-02-23 16:47 emanlee 阅读(157) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 首先QTL是数量性状位点,比如身高是一个数量性状,其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点,而eQTL就是控制数量性状表达位点,即能控制数量性状基因(如身高基因)表达水平高低的那些基因的位点。 数量性状基因座:控制数量性状的基因在基因组中的位置称数量性状基因座。常利用DNA分子标记技术对这些区域进 阅读全文
posted @ 2020-02-22 21:24 emanlee 阅读(3196) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing) 是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的用于研究染色质可及性( 阅读全文
posted @ 2020-02-22 18:57 emanlee 阅读(2493) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Hi-C是研究三维结构的一种方法。Hi-C技术源于染色体构象捕获(Chromosome Conformation Capture, 3C)技术,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质三维结构信息。 背景介绍DNA在染色体上 阅读全文
posted @ 2020-02-21 22:15 emanlee 阅读(3690) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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