摘要: The term k-mer (or x-mer where x can be virtually any consonant of choice) usually refers to a specific n-tuple or n-gram of nucleic acid or amino acid sequences that can be used to identify certain r... 阅读全文
posted @ 2011-12-15 22:24 emanlee 阅读(810) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 动物所piRNA的高精度预测算法研究获得突破 第二代测序技术又称作深度测序技术,应用到RNA上统称作RNA-seq或RNA测序,它已成为基因表达和转录组分析的重要手段。第二代转录组测序数据中含有大量不编码蛋白质的ncRNA序列,因为它们像宇宙中的暗物质一样难以识别和有重要功能,也被称为“基因组暗物质”。由于数据量巨大,保守性差,又有噪音干扰,这些“暗物质”的识别成为表观遗传学和调控网络研究的瓶... 阅读全文
posted @ 2011-12-15 22:22 emanlee 阅读(441) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 基因组印记是指来自父方和母方的等位基因在通过精子和卵子传递给子代时发生了修饰,使带有亲代印记的等位基因具有不同的表达特性,这种修饰常为DNA甲基化修饰,也包括组蛋白乙酰化、甲基化等修饰。在生殖细胞形成早期,来自父方和母方的印记将全部被消除,父方等位基因在精母细胞形成精子时产生新的甲基化模式,但在受精时这种甲基化模式还将发生改变;母方等位基因甲基化模式在卵子发生时形成,因此在受精前来自父方和母方的等... 阅读全文
posted @ 2011-12-15 12:01 emanlee 阅读(3229) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰,调节基因的表达和关闭,与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学的重要研究内容之一。 最常见的甲基化修饰有DNA甲基化和组蛋白甲基化。 DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达。研究证实,CpG二核苷酸中胞... 阅读全文
posted @ 2011-12-15 11:47 emanlee 阅读(3450) 评论(0) 推荐(0) 编辑