linux bash脚本把A和B文件中有相同ID的B文件的内容输出到文件C

bash脚本把A和B文件中有相同ID的B文件的内容输出到文件C.

Aid文件：
ID001.1
ID032.1
ID090.10

Bfilt文件：
XX XX XXX ID001.1 XXX
999999999999999999999999999999999999999
XX XX XXX ID055.1 XXX
6666666666666666666666666666666666666
XX XX XXX ID032.1 XXX
333333333333333333333333333333333333333

要得到Cnew文件：
XX XX XXX ID001.1 XXX
999999999999999999999999999999999999999
XX XX XXX ID032.1 XXX
333333333333333333333333333333333333333

 

awk 'NR==FNR{a[FNR]=$0} NR>FNR{for(i in a)if($0~a[i]){print;getline;print}}' Aid Bfilt >Cnew

 

## 输出匹配id的行，不输出其下一行

awk 'NR==FNR{a[FNR]=$0} NR>FNR{for(i in a)if($0~a[i]){print;}}' Aid Bfilt

 注意：

1 当文件很庞大时，这个十分慢；用 extractfastabyid 处理。

2 这个匹配是包含关系， AAA会匹配AAA1，AAAAA1等。