bigwig文件转换为big文件

将bigwig转换为wig

 

conda install -c bioconda ucsc-bigwigtowig
bigWigToWig signal.bigWig signal.wig


bigWigToWig ：
Convert bigWig to wig.
wget http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/bigWigToWig
chmod +x bigWigToWig
bigWigToWig ENCFF126HQH.bigWig ENCFF126HQH.wig

bigWigToWig: error while loading shared libraries: libssl.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory
原因：系统的libssl.so.1.0.0文件不能找到
解决问题：在系统中查找该文件，如有，建立连接 使得能够找到该库文件，如果没有下载
sudo ln /lib/x86_64-linux-gnu/libssl.so.1.0.0 /usr/lib/libssl.so.10

(base) []# locate libssl.so.1.0.0
/home/user01/anaconda3/lib/libssl.so.1.0.0

(base) []# cp /home/user01/anaconda3/lib/libssl.so.1.0.0 ./

# more ENCFF126HQH.wig
#bedGraph section chr1:0-911538
chr1    0    68294    0
chr1    68294    68509    1.07497
chr1    68509    87093    0
chr1    87093    87202    1.07497
chr1    87202    87308    0.80428
chr1    87308    88163    0
chr1    88163    88378    1.07497




使用 pyBigWig 模块查看 bigwig 文件中的内容
https://blog.csdn.net/weixin_43569478/article/details/111503530

posted @ 2023-01-28 23:55  emanlee  阅读(296)  评论(0)  编辑  收藏  举报