edgeR的使用

edgeR包是进行RNA-seq数据分析非常常用的一个R包。该包需要输入每个基因关于每个样本的reads数的数据，每行对应一个基因，每一列对应一个样本。

 

安装edgeR

先启动R，然后运行下面代码：
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("edgeR")

使用edgeR

library(edgeR)

 

 

REF

http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/edgeR.html

https://blog.csdn.net/hzau_yang/article/details/78118257