课题自研-癫痫

背景介绍

癫痫介绍

• 网址
• 检查手段
  • 最常见：脑电图EEG（甚至是高密度EEG）
  • 包含MRI、fMRI、CT、PET、SPECT在内的多种影像手段
  • 甚至还包括统计参数图SPM、电源成像ESI、脑磁图MEG
• 治疗方式
  • 吃药：最先考虑，但有副作用（轻微的可能出现头晕、疲劳、皮疹、体重增长、骨密度下降等，严重的可能出现肝炎、抑郁、自杀想法和行为等），且有时吃药也不能完全控制
  • 手术：吃药不管用的时候可以考虑手术，手术区域必须小而明确，且不影响重要功能（如言语、语言、运动功能、视力或听力）
  • 电刺激：迷走神经电刺激、脑深部刺激、反应性神经刺激（无副作用）
  • 饮食疗法（生酮饮食）
  • 未来：MRI引导下的微创手术、持续刺激癫痫发作区（阈下刺激）、经颅磁刺激（TMS）、外部三叉神经刺激
• 解剖位置
  

文献调研

杂志官网搜索epilepsy

MIA: Medical Image Analysis（IF: 10.9）

• 2020年
  • Regularized siamese neural network for unsupervised outlier detection on brain multiparametric magnetic resonance imaging: Application to epilepsy lesion screening
    1.个人数据
    -21 people with epilepsy (难治性癫痫患者：FCD and other subtle brain anomalies)
    -75 healthy controls
    -T1（ROI）, FLAIR, 1.5T
    2.癫痫病灶检测，异常检测的思路：通过在正常脑数据上训练，然后能识别出癫痫患者的大脑癫痫区域
    3.30–80%的患病cases的MRI图没有发现癫痫，所提模型检测这些cases，检出率为61%

JMRI: Journal of Magnetic Resonance Imaging（IF: 4.4）

• 2023年
  • MRI-Based Radiomics Approach for Differentiating Juvenile Myoclonic Epilepsyfrom Epilepsy with Generalized Tonic–Clonic Seizures Alone
    -个人数据
    -区分 Juvenile Myoclonic Epilepsy（JME）和 Generalized Tonic–Clonic Seizures Alone（GTCA）
    -AUC：0.7x
  • Advances in Neuroimaging and Multiple Post-Processing Techniques for Epileptogenic Zone Detection of Drug-Resistant Epilepsy
    -针对耐药性癫痫的致痫区检测方法的综述

欧放（2020-2023）: European Radiology（IF: 5）

⭐文献众多（总共12篇），建议先统计一下高频关键词，发现如下：
1.研究区域主要是颞叶，颞叶癫痫（temporal lobe epilepsy）出现在了6篇当中，任务分布为：代谢(FDG PET)/预后(FDG PET/MRI)/预后(FDG PET/MRI)/预后(FDG PET/MRI)/改善偏侧化(T2 mapping/FDG PET)/术前定位(FDG PET/MRI)
2.影像主要是FDG PET/MRI，尤其是FDG PET，出现在了7篇当中，且多与（5/7）颞叶癫痫同时出现
3.任务主要是致痫区术前定位/检测，出现在了4篇当中，一般用FDG PET/MRI
4.预后评估也有4篇，多是研究的颞叶癫痫，一般也使用FDG PET/MRI
-颞叶癫痫，6
-特发性全身性癫痫，1，大小脑连接
-罗兰迪克癫痫，1，大脑发育迟缓
-检测局灶性癫痫致痫区，1
-预测中风后癫痫的组学模型，1
-难治性癫痫的定位和预后（FDG PET/MRI），1
-癫痫患者致痫区定位（FDG PET），1

• 2022年
  • Correction to: [18F]FDG PET/MRI and magnetoencephalography may improve presurgical localization of temporal lobe epilepsy
    • PET/MRI，脑磁图
• 2019年
  • Machine learning identifies “rsfMRI epilepsy networks” in temporal lobe epilepsy
    • Machine learning，identifies
• 2020年
  • Performance of PET imaging for the localization of epileptogenic zone in patients with epilepsy: a meta-analysis
    • PET，localization

PubMed数据库（2020-2023）

⭐发现如下：
1.基因分析是主流（4/12），例如基因变异，影响蛋白表达。是一种对发病机理的研究
2.围绕难治性癫痫展开的研究也是一大热门（2/12）
3.多数采用了ESI、MEG疗法
-基因研究，4
-热性感染相关癫痫综合征，1
-难治性癫痫的药物治疗，1
-无侵入地绘制发作期间波纹，估计致痫区，1，高密度EEG(HD-EEG)和脑磁图（MEG）
-斯特奇-韦伯综合征患者癫痫治疗，1
-ESI(electric source imaging)预测小儿癫痫的手术结果
-发作间期MSI和ESI在MRI阴性的耐药性癫痫（DRE）患者中的效用，1
-药物难治性局灶性癫痫，1
-磁共振成像引导手术，1

公开数据集

MRI数据库

• An open presurgery MRI dataset of people with epilepsy and focal cortical dysplasia type II
  • 目的：读一下README，简单说来就是定位癫痫致癫区，从而手术去除
  • SIGN IN 即可下载（已下载，放在了\mega\MRIData\OpenNEURO）
  • 85 people with epilepsy due to focal cortical dysplasia (FCD) type II
  • 85 healthy controls
  • data: sequence(T1.nii.gz, FLAIR.nii.gz（ROI.nii.gz）)3T; clinical features(很详细，17项)
  • ⭐（值得一读）对应文章：An open presurgery MRI dataset of people with epilepsy and focal cortical dysplasia type II
  • 基于对ER上发表的文章的统计分析，这里也针对颞叶癫痫进行了数据统计，只有10例

数据没了

• 文章网址
  • 他妈的，数据网站居然被劫持，搞笑欸😂，点开居然是他妈的彩票网站。。。(ˉ▽ˉ；)...
  • 没数据，没啥用，但是有11个分割评价指标可以参考
  • 海马体分割，有标注
  • T1模态，总共50张，癫痫(40张)和非癫痫(10张)
  • 训练集：25张，测试集：25张

又没了。。。

• 文章网址
  • 又挂了，无语到家了(ˉ▽ˉ；)...
  • 可惜了，感觉数据还挺好的（见摘要）