【图嵌入】DeepWalk 和 Node2Vec
DeepWalk
与词嵌入类似,图嵌入基本理念是基于相邻顶点的关系,将目的顶点映射为稠密向量,以数值化的方式表达图中的信息,以便在下游任务中运用。
Word2Vec根据词与词的共现关系学习向量的表示,DeepWalk受其启发。它通过随机游走的方式提取顶点序列,再用Word2Vec模型根据顶点和顶点的共现关系,学习顶点的向量表示。可以理解为用文字把图的内容表达出来,如下图所示。
DeepWalk训练图表示的整个过程大致可以分为2步:
- 随机游走提取顶点序列
- 使用skip-gram学习顶点嵌入
训练时采用层次Softmax(Hierarchical Softmax)优化算法,避免计算所有词的softmax。
Node2Vec
DeepWalk不适用于有权图,它无法学习边上的权重信息。Node2Vec可以看作DeepWalk的扩展,它学习嵌入的过程也可以分两步:
- 二阶随机游走(\(2^{nd} \quad order \quad random \quad walk\))
- 使用skip-gram学习顶点嵌入
可以看到与DeepWalk的区别就在于游走的方式,在二阶随机游走中,转移概率 \(\pi_{vx}\) 受权值 \(w_{vx}\) 影响(无权图中\(w_{vx}\)为1):
其中,
\(\alpha_{pq}\) 的取值由 \(p\) 和 \(q\) 决定,\(d_{tx}\) 是顶点 \(t\) 和 \(x\) 的最短路径。
\(d_{tx}=0\)说明\(x\)就是\(t\),\(d_{tx}=1\)说明\(x\)和\(t\)邻接,\(d_{tx}=2\)说明\(x\)和\(t\)不是邻接的。
算法通过\(p\)、\(q\)两个超参数来控制游走到不同顶点的概率。以下图为例,图中阐述了从上一顶点 \(t\) 游走到当前顶点 \(v\),准备估计如何游走到下一个顶点的过程。
- \(q\):控制“向内”还是“向外”游走。若\(q > 1\),倾向于访问与 \(t\) 接近的顶点,若 \(q<1\) 则倾向于访问远离 \(t\) 的顶点。
- \(p\):控制重复访问刚刚访问过的顶点的概率。若设置的值较大,就不大会刚问刚刚访问过的顶点。若设置的值较小,那就可能回路返回一步。
还有一个值得注意的地方,与DeepWalk不同,Node2Vec在提取顶点序列时,不再是简单地随机取邻居顶点,而是采用了Alias算法。
Alias采样是为了加快采样速度,初始化后的采样时间复杂度为\(O(1)\),但需要存储 accept 和 alias 两个数组,空间复杂度为\(O(2N)\)。这里简单介绍一下。
给定如下离散概率分布,有 \(N\)个 (这里是4)可能发生的事件。每列矩形面积表示该事件发生的概率,柱状图中所有矩形的面积之和为 1。
将每个事件的发生的概率乘以 \(N\),此时会有部分矩形的面积大于1,部分矩形的面积小于1。切割面积大于1的矩形,填补到面积小于1的矩形上,并且每一列至多由两个事件的矩形构成,最终组成一个面积为 \(1\times N\) 的矩形。
再根据这个矩形,转换成相应的Accept表和Alias表。
Node2Vec在随机游走之前会进行初始化,获取 alias_nodes 和 alias_edges 。alias_nodes 存储每个顶点决定下一个访问的点所需要的alias表,alias_edges则存储由\((t, v)\)边访问到顶点\(v\)的时候决定下一个访问点所需要的alias表。
alias_nodes与alias_edges的差别在于,alias_nodes不考虑当前顶点之前访问的顶点,它用在游走最开始的时候,此时没有“上一个顶点”。
关于 alias 采样算法更详细的内容,可以参考下面两个链接。
https://shomy.top/2017/05/09/alias-method-sampling/
https://blog.csdn.net/manmanxiaowugun/article/details/90170193
后面就跟DeepWalk一样了,但是原作者在训练Word2Vec模型的时候,没有采用层次Softmax。
代码
https://gitee.com/dogecheng/python/blob/master/graph/DeepWalk_and_Node2Vec.ipynb
DeepWalk 可视化
Node2Vec 可视化
参考资料
腾讯安全威胁情报中心“明厨亮灶”工程:基于域名图谱嵌入的恶意域名挖掘
DeepWalk: Online Learning of Social Representations
node2vec: Scalable Feature Learning for Networks
【Graph Embedding】DeepWalk:算法原理,实现和应用