摘要： 1、下载地址：https://sourceforge.net/projects/goldendict/，注意不要去官网下载，官网太旧解压后，在安装目录建立一个文件夹，命名为portable；在content文件夹中建立一个dic文件夹用于存放字典 2、设置 2、词典简介 Oxford Adv 阅读全文

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2020年3月12日

Python Data Analytics With Pandas, NumPy, and Matplotlib

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2020年3月9日

SV饼图及条形图

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R群体

摘要： 1、vcfR BiocManager::install('vcfR') library('vcfR') library(pinfsc50) library(reshape2) library(ggplot2) vcf <- system.file('extdata','pinf_sc50.vcf.g 阅读全文

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2020年3月1日

基因组组装工具下载

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2020年2月27日

注释基因组数据下载方法(经典，普世)

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2020年2月21日

基因组注释之软件使用参数教程

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2020年2月19日

注释数据库下载地址及其版本

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2020年2月7日

登录学校VPN

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2020年1月16日

基因组注释之重复序列及基因结构预测及注释

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2020年1月15日

HIC-挂载之3d-DNA-Juicer

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2020年1月14日

samtools中faidx索引格式

摘要： 1、faidx格式第一列 NAME: 序列的名称，只保留“>”后，第一个空白之前的内容；第二列 LENGTH: 序列的长度，单位为bp；第三列 OFFSET: 第一个碱基的偏移量，从0开始计数，换行符也统计进行；第四列 LINEBASES : 除了最后一行外，其他代表序列的行的碱基数，阅读全文

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2020年1月12日

Conservation and the genetics of population重要语录

摘要：第一章 0、demographic：statistical description of populations 1、Extinction is a demographic process: the failure of one generation to replace itself with a 阅读全文

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2020年1月11日

图形分类

摘要： 1、棒棒糖图（LollipopChart）棒棒糖图传达了跟柱形图或者条形图相同的信息，只是将矩形转变成线条，这样可减少展示空间，重点放过在数据点上，从而看起来更加简洁与美观。相对于柱形图与条形图，棒棒糖图更加适合数据量比较多的情况。图(a)为横向棒棒糖图，对应条形图；而如果是纵向棒棒糖图则对于柱形阅读全文

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2020年1月10日

HIC挂载之HIC-pro

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2020年1月4日

第二章，存储系统

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2020年1月1日

计算机系统

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2019年12月30日

电脑网络知识理解

摘要：网卡 0、网卡(网络适配器) 01、简介网卡是一块被设计用来允许计算机和计算机网络上进行通讯的计算机硬件，拥有MAC地址。它使得用户可以通过电缆或无线相互连接。每一个网卡都有一个被称为MAC地址的独一无二的 48位串行号，它被写在卡上的一块ROM中。在网络上的每一个计算机都必须拥有一个独一无二的阅读全文

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2019年12月28日

UCSC工具

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bigBed及bigWig格式

摘要： bigBed 1、bigBed格式 BigBed文件是使用bedToBigBed程序从BED类型文件创建的。结果得到的bigBed文件是二进制索引文件。bigBed文件的主要优点是，仅将显示特定区域所需的文件部分传输到Genome浏览器服务器。因此，在处理大数据集时，bigBed的显示性能要比常规B 阅读全文

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2019年12月27日

deeptools 处理bam文件

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2019年12月21日

bam排序及未排序，去重及未去重

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2019年12月20日

安装picard

摘要： 1、下载 wget https://github.com/broadinstitute/picard/releases/download/2.21.6/picard.jar alias picard='java -jar /home/share/biosoft/picard/picard.jar' 阅读全文

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处理NCBI-blast-taxon等，taxonkit ，csvtk及配套数据库

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2019年12月17日

nanopack

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2019年12月16日

guppy

摘要： 1、下载 wget https://mirror.oxfordnanoportal.com/software/analysis/ont-guppy-cpu_3.4.1_linux64.tar.gz 阅读全文

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二代及三代群体SV

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2019年12月15日

群体遗传之ped格式

摘要： 1、PED简介 PED文件格式是广泛使用的用于连锁系谱数据分析的格式，并用作plink程序的输入。PLINK是一个免费的，开源的全基因组关联分析工集，旨在以高计算效率的方式执行一系列基本的，大规模的分析。PED能够处理二倍体SNP数据。 plink可以接收vcf格式文件，但是plink更倾向于自己的阅读全文

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服务器系统管理常用命令

摘要： 1、基本 grep MemTotal /proc/meminfo ## 查看服务器内存 grep "model name" /proc/cpuinfo ## 查看服务器CPU/处理器详细信号等 grep "physical id" /proc/cpuinfo | sort | uniq | wc - 阅读全文

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2019年12月14日

群体遗传软件Genepop及格式转换软件PGDSpider的安装与使用

摘要： 1、下载并安装genepop wget http://kimura.univ-montp2.fr/%7Erousset/GenepopV4.tar.gz gunzip GenepopV4.tar.gz tar zxvf sources.tar.gz for i in {Genepop，bootstr 阅读全文

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2019年12月12日

vim跳到最后和最前

摘要： 1、跳到尾部和首部 :0或:1跳到文件第一行 :$跳到文件最后一行阅读全文

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2019年12月8日

谱系不完全分选

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2019年12月6日

INVERSION包

摘要： 1、安装该包 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))install.packages("BiocManager") BiocManager::install('inveRsion') 阅读全文

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2019年12月5日

nanopor软件列表

摘要： 1、软件阅读全文

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