12 2019 档案

• 电脑网络知识理解
  摘要：网卡 0、网卡(网络适配器) 01、简介 网卡是一块被设计用来允许计算机和计算机网络上进行通讯的计算机硬件，拥有MAC地址。它使得用户可以通过电缆或无线相互连接。每一个网卡都有一个被称为MAC地址的独一无二的 48位串行号，它被写在卡上的一块ROM中。 在网络上的每一个计算机都必须拥有一个独一无二的 阅读全文
  posted @ 2019-12-30 11:43 发那个太丢人 阅读(664) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• UCSC工具
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  posted @ 2019-12-28 15:08 发那个太丢人 阅读(2) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• bigBed及bigWig格式
  摘要：bigBed 1、bigBed格式 BigBed文件是使用bedToBigBed程序从BED类型文件创建的。结果得到的bigBed文件是二进制索引文件。bigBed文件的主要优点是，仅将显示特定区域所需的文件部分传输到Genome浏览器服务器。因此，在处理大数据集时，bigBed的显示性能要比常规B 阅读全文
  posted @ 2019-12-28 10:16 发那个太丢人 阅读(5005) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• deeptools 处理bam文件
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  posted @ 2019-12-27 23:42 发那个太丢人 阅读(13) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• bam排序及未排序，去重及未去重
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  posted @ 2019-12-21 17:29 发那个太丢人 阅读(6) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• 安装picard
  摘要：1、下载 wget https://github.com/broadinstitute/picard/releases/download/2.21.6/picard.jar alias picard='java -jar /home/share/biosoft/picard/picard.jar' 阅读全文
  posted @ 2019-12-20 22:46 发那个太丢人 阅读(1218) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• 处理NCBI-blast-taxon等，taxonkit ，csvtk及配套数据库
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  posted @ 2019-12-20 16:11 发那个太丢人 阅读(13) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• nanopack
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  posted @ 2019-12-17 17:21 发那个太丢人 阅读(5) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• guppy
  摘要：1、下载 wget https://mirror.oxfordnanoportal.com/software/analysis/ont-guppy-cpu_3.4.1_linux64.tar.gz 阅读全文
  posted @ 2019-12-16 21:03 发那个太丢人 阅读(749) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• 二代及三代群体SV
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  posted @ 2019-12-16 16:39 发那个太丢人 阅读(2) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• 群体遗传之ped格式
  摘要：1、PED简介 PED文件格式是广泛使用的用于连锁系谱数据分析的格式，并用作plink程序的输入。PLINK是一个免费的，开源的全基因组关联分析工集，旨在以高计算效率的方式执行一系列基本的，大规模的分析。PED能够处理二倍体SNP数据。 plink可以接收vcf格式文件，但是plink更倾向于自己的 阅读全文
  posted @ 2019-12-15 22:38 发那个太丢人 阅读(4800) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• 服务器系统管理常用命令
  摘要：1、基本 grep MemTotal /proc/meminfo ## 查看服务器内存 grep "model name" /proc/cpuinfo ## 查看服务器CPU/处理器详细信号等 grep "physical id" /proc/cpuinfo | sort | uniq | wc - 阅读全文
  posted @ 2019-12-15 13:31 发那个太丢人 阅读(346) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• 群体遗传软件Genepop及格式转换软件PGDSpider的安装与使用
  摘要：1、下载并安装genepop wget http://kimura.univ-montp2.fr/%7Erousset/GenepopV4.tar.gz gunzip GenepopV4.tar.gz tar zxvf sources.tar.gz for i in {Genepop，bootstr 阅读全文
  posted @ 2019-12-14 19:28 发那个太丢人 阅读(2355) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• vim跳到最后和最前
  摘要：1、跳到尾部和首部 :0或:1跳到文件第一行 :$跳到文件最后一行 阅读全文
  posted @ 2019-12-12 12:38 发那个太丢人 阅读(2429) 评论(0) 推荐(1) 编辑
• 谱系不完全分选
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  posted @ 2019-12-08 18:27 发那个太丢人 阅读(2) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• INVERSION包
  摘要：1、安装该包 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))install.packages("BiocManager") BiocManager::install('inveRsion') 阅读全文
  posted @ 2019-12-06 20:46 发那个太丢人 阅读(104) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• nanopor软件列表
  摘要：1、软件 阅读全文
  posted @ 2019-12-05 11:19 发那个太丢人 阅读(86) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• linux字体，bashrc的问题的解决
  摘要：0、查看文件 :set ff #查看文件类型 这里是fileformat=unix :set ff=dos 设置为dos模式， 也可以用 sed -i 's/$/\r/' :set ff=unix 设置为unix模式，也可以用一下方式转换为unix模式:sed -i 's/.$//g' :set f 阅读全文
  posted @ 2019-12-04 16:33 发那个太丢人 阅读(861) 评论(0) 推荐(0) 编辑
• delly使用
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  posted @ 2019-12-02 20:13 发那个太丢人 阅读(2) 评论(0) 推荐(0) 编辑