正则表达式
摘要:0、基本知识 正则12个元符号: backslash \ the caret ^ #match a position the dollar sign $ #matches at the end of the string, the period or dot . the vertical bar o
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第六章 系统发育推断:距离法
摘要:6.1、UPGMA 6.2、最小二乘(LS)法
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第五章 系统发育树
摘要:5.1、系统发育树的种类 5.2、拓扑结构 5.3、构树方法
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第四章 同义与非同义的核苷酸替代
摘要:4.0、前言 估计同义突变和非同义替代发生的速率,比估计核苷酸替代数目要复杂的多。估算dS和dN,有很多种方法,归纳为三类:1、进化通经法;2、基于Kimura双参估计法;3、密码子替代模型的最大似然法 4.1、进化通经法 考虑2个DNA序列间每对同源密码子的所有可能进化通经,由此提出一种估算dS和
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第三章,DNA序列的进化演变
摘要:31、前言 3.1、两个序列间的核苷酸差异 来自同一祖先序列的两条后裔序列,之间的核苷酸的差异随着时间的增加而变大。简单的计量方法,p距离 3.2、核苷酸代替数的估计 3.3、Jukes和Cantor模型 该模型假定任一位点的核苷替代都已相同频率发生,且每一位点的核苷酸每年以α概率演变为其它任意3种
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