摘要:
1)Sam (Sequence Alignment/Map) 1) SAM 文件产生背景 随着Illumina/Solexa, AB/SOLiD and Roche/454测序技术不断的进步,各种比对工具产生,被用来高效的将reads比对到参考基因组。因为这些比对工具产生不同格式的文件,导致下游分析 阅读全文
摘要:
1)知识简介 1.1)测序质量值 首先在了解fastq,fasta之前,了解一下什么是质量值。phred软件在对reads进行base calling的时候会给出每一个碱基的质量值,这个质量值的计算与测序预期错误率相关(estimated probability of error): 除此之外还有s 阅读全文