摘要: 它这个类似charmm里的prm。不过这个Rosetta可以自动帮你生成prm。 1、从pdb中获得配体。(这一步我不是很会,不过可以用高斯view进行一个结构优化得到配体) 2、进行加H步骤,实际上就是H优化,这一步也是可以用高斯来进行,直接优化结构。 3、使用molfile—to—param.p 阅读全文