摘要: MindSponge分子动力学模拟——自建力场(2024.03) 基于力场的分子动力学模拟,其实可以看做是一个最简单的机器学习模型,具有计算成本低的特点,在药物研发、生物化学和计算物理学等研究领域存在广泛的应用。那么,如何去快速的开发一个新的力场,在传统的MD模拟软件中其实可能是一个不小的门槛,而基于MindSpore框架开发的MindSponge分子动力学模拟软件,则具有这种便捷开发的特性。本文通过一个简单的示例,介绍了如何在MindSponge分子动力学模拟框架内构建一个自定义的分子力场,可以正常的执行分子动力学模拟迭代过程并保存相应的结果和输出。 阅读全文
posted @ 2024-03-22 17:46 DECHIN 阅读(255) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: MindSpore报错处理:TypeError: For 'set_context', the parameter device_id can not be set repeatedly, origin value [0] has been in effect. 本文主要介绍了一个在使用MindSpore框架进行编程的时候遇到的一个小问题--重复设定运算设备的编号。之所以会出现这个问题,是因为在调用的包里面有对MindSpore的引用,里面还包含了一些基于MindSpore的运算和即时编译,因此如果不给定设备编号的话,MindSpore内部会默认分配一个设备编号。而如果我们在自己的测试案例中又希望指定一个设备编号,那么就要把这个set_context句柄放在引用的最前面。 阅读全文
posted @ 2024-03-22 10:13 DECHIN 阅读(145) 评论(0) 推荐(0) 编辑