2023年9月6日
MindSponge分子动力学模拟——Constraint约束（2023.09）
摘要： MindSponge分子动力学模拟——Constraint约束（2023.09） 本文主要介绍了在MindSponge中使用SETTLE和Lincs约束算法的方法，以及相关算法的简单原理。SETTLE约束算法主要应用于水分子体系，限制的是一个等腰三角形的拓扑结构，特点是可并行，性能较好。Lincs约束算法更多的被应用在蛋白质体系，主要限制的是每一个共价键的键长，特点是适用体系比较灵活，但总体计算量较大，且不可并行化。 阅读全文
posted @ 2023-09-06 15:48 DECHIN 阅读(443) 评论(17) 推荐(0) 编辑