2022年6月28日
从Hadder看蛋白质分子中的加氢算法
摘要： 从Hadder看蛋白质分子中的加氢算法 本文主要介绍了开源加氢软件Hadder中用到的一些常规的补氢算法。在存储和优化蛋白质结构的过程中，人们更多的关注于蛋白质本身的骨架的变化，而单个原子的细微变化，对整体产生的性质是微乎其微的。但是我们在建立力场以及做能量最小化的过程中，需要用到氢原子。而氢原子的初始位置是至关重要的，如果加的位置太差，有可能导致体系能量过大，从而出现梯度爆炸的问题。 阅读全文
posted @ 2022-06-28 15:22 DECHIN 阅读(883) 评论(0) 推荐(0) 编辑