摘要: 氨基酸分子结构和原子命名 PDB格式的文件是最常用于存储蛋白质构象的一种,其中也是以各个氨基酸(残基)为基本单位,在氨基酸内部对原子进行唯一性的命名。本文先通过展示各种氨基酸在蛋白质链的不同位置的结构,介绍各类氨基酸的基础构象。再通过丙氨酸和色氨酸两个案例,详细介绍了在蛋白质链的中的各种氨基酸内部的原子命名法则。需要注意的是,atom_name和atom_type是不一样的,atom_name是一个唯一的标识符,atom_type则是用于导出力场参数的重要标记。 阅读全文
posted @ 2022-06-17 10:46 DECHIN 阅读(3988) 评论(0) 推荐(0) 编辑