2020年6月22日
摘要：
mkdir 命令用来创建指定名称的目录，要求创建目录的用户在当前目录中具有写权限，并且指定的目录名不能是当前目录中已有的目录。 阅读全文
摘要：
cp命令用来复制文件或者目录，是Linux系统中最常用的命令之一。一般情况下，shell会设置一个别名，在命令行下复制文件时，如果目标文件已经存在，就会询问是否覆盖，不管你是否使用-i参数。但是如果是在shell脚本中执行cp时，没有-i参数时不会询问是否覆盖。这说明命令行和shell脚本的执行方式有些不同。 阅读全文
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cd命令，切换当前目录至dirName 阅读全文
摘要：
Linux中用 pwd 命令来查看”当前工作目录“的完整路径。简单得说，每当你在终端进行操作时，你都会有一个当前工作目录。在不太确定当前位置时，就会使用pwd来判定当前目录在文件系统内的确切位置。 阅读全文
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ls命令就是list的缩写，默认条件下ls用来打印出当前目录的清单。如果ls指定其他目录，那么就会显示指定目录里的文件及目录清单。 通过ls 命令不仅可以查看Linux目录包含的文件，而且可以查看文件权限(包括目录)，查看目录信息等等。 阅读全文
摘要：
VCF是用于描述SNP，INDEL和SV结果的文件，下面所记录的是以GATK软件结果的VCF文件，与SAMtools的结果有点不同 阅读全文
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SAM文件由两部分组成：头部信息和比对信息，都是以tab键分隔。 阅读全文
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BED文件每行至少包含chrom，chromStart，chromEnd三列；另外还可以添加额外的9列，这些列的顺序是固定的。 阅读全文
摘要：
在Gradient Boosting中则将负梯度作为上一轮基学习器犯错的衡量指标，在下一轮学习中通过拟合负梯度来纠正上一轮犯的错误。这里的关键问题是：为什么通过拟合负梯度就能纠正上一轮的错误了？Gradient Boosting的发明者给出的答案是：函数空间的梯度下降。 阅读全文
