摘要: 一、使用GATK前须知事项:(1)对GATK的测试主要使用的是人类全基因组和外显子组的测序数据,而且全部是基于illumina数据格式,目前还没有提供其他格式文件(如Ion Torrent)或者实验设计(RNA-Seq)的分析方法。(2)GATK是一个应用于前沿科学研究的软件,不断在更新和修正,因此... 阅读全文
posted @ 2015-12-30 16:45 SamYangBio 阅读(9811) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: BSA(Bulked Segregant Analysis)又称混合群体分离分析法,是利用极端性状进行功能基因挖掘的一种方法。主要思想是将两个具有极端性状的群体进行混池测序,比较两个群体在多态位点(SNP)的Allele Frequency(AF)是否具有显著差异。以植物株高性状为例,收集株高处于两 阅读全文
posted @ 2015-12-30 16:15 SamYangBio 阅读(4140) 评论(0) 推荐(0) 编辑