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2013年10月23日

摘要： Make sure public inheritance models “is –a “ 如果令clsss D 以public的形式继承class B,你便是告诉编译器说,每一个类型为D的对象同时也是一个类型为B的对象，反之不成立。你的意思是B比D表现出更一般化的概念，而D比B表现出更特殊化的概念。你主张"B"对象可以派上用场的任何地方，D对象一样可以派上用场。因为每一个D对象都是一个B对象。反... 阅读全文

posted @ 2013-10-23 14:13 CrazyCode. 阅读(147) 评论(0) 推荐(0) 编辑

条款29：为“异常安全”而努力是值得的

摘要：当异常被抛出时,带有异常安全性的函数: 1.不泄露任何资源 2.不允许数据败坏异常安全函数提供以下三个保证之一: 1.基本承诺:如果异常被抛出，程序内的任何事物仍然保持在有效的状态下。没有任何对象或数据结构会因此而败坏，所有对象都处于一种内部前后一致的状态。 2.强烈保证:如果异常被抛出,程序状态不改变.调用这样的函数需有这样的认知：如果函数成功，就是完全成功，如果函数失败，程序... 阅读全文

posted @ 2013-10-23 09:21 CrazyCode. 阅读(215) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2013年10月18日

条款20.宁以pass-by-reference-to-const替换pass-by-vlaue

摘要：缺省情况下c++以by value的方式传递对象至(或来自)函数。除非你另外指定，否则函数参数都是以实际实参的复件（副本）为初值，而调用端所获得的亦是函数返回值的一个复件。这些复件是由对象的copy构造函数产出，这可能使得pass-by-value成为昂贵的操作. #include "stdafx.h" #include #include class Wind... 阅读全文

posted @ 2013-10-18 16:29 CrazyCode. 阅读(173) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2013年10月15日

对引用要注意

摘要： int a =2,b=3; int &c= a; c指向a以后就永久的指向a了 cout<<c<<endl; c=b;//这里并不是让c指向了b.然后让a=b; cout<<a<<endl; 阅读全文

posted @ 2013-10-15 13:29 CrazyCode. 阅读(116) 评论(0) 推荐(0) 编辑

基因组拼接中常见的名词解释

摘要： Read：高通量测序平台产生的序列就称为reads。 Contig：拼接软件基于reads之间的overlap区，拼接获得的序列称为Contig（重叠群）。 Scaffold：基因组de novo测序，通过reads拼接获得Contigs后，往往还需要构建454 Paired-end库或Illumina Mate-pair库，以获得一定大小片段（如3Kb、6Kb、10Kb、20Kb）两端的序列... 阅读全文

posted @ 2013-10-15 00:04 CrazyCode. 阅读(575) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2013年10月14日

序列联配(alignment)和数据库搜索方法简介

摘要：根据一个打分系统,怎么样排对起来打分能够最大.就认为历史上应该是这样子的. 数据同源搜索软件Fasta和Blast 是目前功能最全，使用最广的同源性数据库搜索软件包。他们在Needleman的动态算法的基础上做了很多技术上的改进，如采用启发式算法。使得在精确度牺牲较小的情况下，速度快了很多。 FASTA.是1985年提出的一个全局联配算法. BLAST.是1990年提出的。最初被设计... 阅读全文

posted @ 2013-10-14 10:58 CrazyCode. 阅读(620) 评论(0) 推荐(0) 编辑

几个重要生物信息中心及其数据库服务

摘要： NCBI的检索软件ENtrez及两大数据库：GenBank和RefSeq EBI的核酸序列数据库EMBL及其它服务上面这两个主要是针对核酸的 Swiss-Prot蛋白序列数据库(蛋白质服务用) PDB生物大分子三维结构数据库. SCOP蛋白质结构分类数据库。 Entrez及两大数据库:GenBank和RefSeq NCBI:美国国家生物技术信息中心(National Cent... 阅读全文

posted @ 2013-10-14 10:06 CrazyCode. 阅读(1910) 评论(0) 推荐(0) 编辑

复杂分析-多序列比对相关

摘要：用一段序列的复杂度来测度这段序列可能是编码区呢？还是编码区？如果这短序列的复杂性越高，也就是说花样越多的话。这段序列越像是编码区。外显子是被内含子隔开的. 用数据库资源如何发现新基因通过数据库资源发现新基因的途径: 1.这两个途径就是你用了什么样的数据库资源,利用数据库当中的基因组序列进行来发现新的基因.发现新的编码序列.通过实验得到的基因组序列发现先的编码序列。原理是... 阅读全文

posted @ 2013-10-14 08:46 CrazyCode. 阅读(1185) 评论(1) 推荐(0) 编辑

大规模基因组测序中的信息分析 -- 拼接与注释

摘要：大规模基因组测序中的信息分析 -- 拼接与注释大规模测序是基因组研究的最基本任务，它的每一给环节都与信息分析紧密相关。从测序仪的光密度采样与分析、碱基读出、载体识别与去除、拼接与组装、填补序列间隙、到重复序列标识、读框预测和基因标注的每一步都是紧密依赖基因组信息学的软件和数据库的。 DNA测序仪,测的是光密度。每个碱基是四个不同颜色的光.所以一开始你就需要把光密度变成碱基图样。这是生物信息... 阅读全文

posted @ 2013-10-14 00:34 CrazyCode. 阅读(1692) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2013年10月13日

生物信息学第一课什么是生物信息学

摘要：什么是生物信息学? 他是一个学科领域，包含着基因组信息的获取，处理，存储，分配(第一部分:把信息拿来管好帮助用户使用好)，分析和解释(第二部分:破译遗传信息中生病之类的基本规律,获取基本规律的发掘与获得)的所有方面。从美国的三个国家计划说起：曼哈顿计划(核弹,核能,能源革命)；阿波罗计划(人类探索宇宙，走出地球空间的革命)；人类基因组计划(上个世纪80年代末。90年代初,1990年开始，通过... 阅读全文

posted @ 2013-10-13 23:17 CrazyCode. 阅读(336) 评论(0) 推荐(0) 编辑

世界上有10种人,一种人知道二进制，而另一种人不知道二进制...