摘要: ####conda install pyscenic conda create -n pyscenic python=3.7 conda activate pyscenic conda install -y numpy conda install -y conda-forge::cytoolz #- 阅读全文
posted @ 2024-11-18 20:50 corrschi 阅读(11) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: library(dplyr) library(stringr) setwd("D:\workspace\ouyang\七七八八\基因求交集20241116") data1 <- read.csv("miRDB.汇总.csv",header=T,stringsAsFactors = FALSE) da 阅读全文
posted @ 2024-11-17 00:49 corrschi 阅读(1) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 教程:https://lishensuo.github.io/posts/bioinfo/008单细胞分析工具--monocle轨迹分析/ 关于monocle包的安装(20230311) 最近使用monocle包的orderCells() 函数出现了问题,发现有人已在github提出了相应的解决方案 阅读全文
posted @ 2024-11-14 12:53 corrschi 阅读(305) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 用conflicted包解决 参考:https://blog.csdn.net/qazplm12_3/article/details/119621588 #1 安装软件包 install.packages("conflicted") #2 显示冲突的包 library(conflicted) con 阅读全文
posted @ 2024-04-16 19:01 corrschi 阅读(96) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 参考:https://www.jianshu.com/p/9850c4d88a67 # 1.以pbmc3k为例,加载Seurat数据+设置工作目录 ##### setwd("/public/home/chidm/test/Gene相关性") load("/public/home/chidm/test 阅读全文
posted @ 2024-04-14 22:03 corrschi 阅读(917) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: https://blog.csdn.net/ccc767/article/details/78203906 C:/Users/corrs/AppData/Local/R/win-library/4.2/Matrix 阅读全文
posted @ 2024-04-12 22:07 corrschi 阅读(78) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 链接https://mp.weixin.qq.com/s/Ng5ZHzVo50-JgQcRJfJmSQ 阅读全文
posted @ 2024-04-08 22:18 corrschi 阅读(15) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 效果图 代码 #### 小提琴图数据准备 ##### gene <- c("CD3D","CSTB","APOE","EGFR","VEGFA","IL6") exprs <- data.frame(FetchData(object = c6, vars = c("Anno.chi",gene,"g 阅读全文
posted @ 2024-04-08 22:06 corrschi 阅读(125) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: https://edwindataanalyst.wordpress.com/2020/03/04/ggplot2-title标题设置/ 教程2:https://cloud.tencent.com/developer/article/2162933 教程3:https://cloud.tencent 阅读全文
posted @ 2024-04-08 21:33 corrschi 阅读(15) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: aa=(1:5) rev(aa) bb=LETTER(1:5) rev(bb) 阅读全文
posted @ 2024-04-04 19:13 corrschi 阅读(3) 评论(0) 推荐(0) 编辑