随笔分类 - R软件包
摘要：####conda install pyscenic conda create -n pyscenic python=3.7 conda activate pyscenic conda install -y numpy conda install -y conda-forge::cytoolz #-
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摘要：library(dplyr) library(stringr) setwd("D:\workspace\ouyang\七七八八\基因求交集20241116") data1 <- read.csv("miRDB.汇总.csv",header=T,stringsAsFactors = FALSE) da
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摘要：参考：https://www.jianshu.com/p/9850c4d88a67 # 1.以pbmc3k为例，加载Seurat数据+设置工作目录 ##### setwd("/public/home/chidm/test/Gene相关性") load("/public/home/chidm/test
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摘要：效果图 代码 #### 小提琴图数据准备 ##### gene <- c("CD3D","CSTB","APOE","EGFR","VEGFA","IL6") exprs <- data.frame(FetchData(object = c6, vars = c("Anno.chi",gene,"g
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摘要：aa=(1:5) rev(aa) bb=LETTER(1:5) rev(bb)
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摘要：BiocManager::install("GEOquery") install.packages()无法安装
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摘要：安装"DESeq2", "edgeR", "limma", "clusterProfiler" bioPackages=c("DESeq2", "edgeR", "limma", "clusterProfiler") #设置镜像 local({ r <- getOption( "repos" );
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摘要：devtools可用conda，R的install.packages()以及wget等方式安装，这里我采用install.packages()安装，碰到systemfonts，textshaping, ragg, gert几个依赖包的安装错误。 install.package("devtools")
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