新药开发瓶颈问题或将被打破,北鲲云超算平台开启药物研发“加速度”

在现代医学快速发展的过程中,新药研发扮演着极为重要的角色,但是长期以来,因为初始命中率太低导致的成本过高问题,却成为了药物研发过程中的障碍。据专业人士介绍,一款新药在研制过程中,要涉及到靶标的确定、化合物筛选以及临床试验等众多的环节,这个过程具有周期长、技术难度大以及人力成本高特点,如何解决这一系列痛点问题,成为了摆在医学业界的重要课题。

众所周知,新药研发的链条非常绵长,以目前市场中占比较大的小分子药物为例,首先要基于靶标来筛选化合物,然后在经过一系列的繁琐程序来优化成先导分子,之后再优化成为候选药,最终才会进入临床研究阶段。每个环节都充满了挑战,比如要在动辄120亿的巨量化学空间中筛选出待实验验证的分子,难度可想而知。在高性能计算系统AI等技术的加持下,上述课题正在得到逐步破解,这些技术直击困扰新药研发的瓶颈问题。

目前,业界常用的筛选方式为基于AI技术的超高通量虚拟筛选法,其大致过程是在超级算能的助力下,将化学空间缩小较小的量级,进而进行更加精细的分子对接,最后在人工的辅助下进行进一步的挑选,最终形成理想的交付方案。在这一过程中,基于分子的动力学模拟计算起着重要作用。

目前,国内已经有相关企业在将高性能计算系统用于新药研发方面进行了积极探索,北鲲云超算平台便是其中之一。该平台的一个核心优势就是,它可以大幅提升新药研发过程中数据的筛选效率。借助于北鲲云超算平台的高性能计算服务,1000台拥有16000核心的计算资源可以在短短几分钟的时间就被调动起来,原先需要几天才能完成的计算任务,如今缩短到了10分钟左右,且相关的结果会呈现在平台上,免去了后续的繁杂统计环节。

考虑到新药研发过程中,需要存储巨量的数据,北鲲云超算平台还可以为合作方提供PB级的超大储存空间,这样一来之前的数据就可以被轻松地容纳起来,当需要进行数据的比对时可以随时调取。安全性方面,北鲲云则采用AES-256对数据进行加密传输,确保了相关的数据出现泄露或者被篡改的风险。

高性能计算在医药研发领域的使用,仅仅是其诸多应用体系内的一个分支,在系统生物学、生物学等领域的技术开发,以及数据存储分析过程中,高性能计算均有着用武之地,有媒体曾报道,北鲲云超算平台协助一家高校进行基因组分析,在一周的时间里完成了2000个物种基因组分析,效率之高令人惊叹。随着云计算技术的不断优化升级,它在众多领域将发挥出更加重要的价值!

 

posted @ 2021-08-11 18:35  北鲲云  阅读(88)  评论(0编辑  收藏  举报