北鲲云超算接入GPUA100，让AlphaFold2轻松使用

 

二十年前，生命科学领域几乎没有高性能计算（HPC）的踪迹，现如今高性能计算已被广泛用于生命科学和生物医学研究。并且高性能计算在生命科学领成功案例越来越多，从十几年前就开始的基因测序到去年科学家使用超级计算机抗击新冠肺炎，再到最近大火的AlphaFold2，都是高性能计算在生命科学领域的实践成果。这也意味着高性能计算在生命科学领域的地位越来越重要。

 

以最近大火的AlphaFold2来说，它能够高度准确预测人类98.5%蛋白质，不仅如此，还有大肠杆菌、果蝇、小鼠等20个具有科研常用生物的蛋白质组数据，总计超过35万个蛋白质的结构。我们知道，对于生物制药而言只有了解的蛋白质的分子结构，才能匹配最可能与之结合的化合物，从而使其无法感染宿主细胞，达到最佳的治疗效果。得益于高性能计算的加入，大幅提高了生物大分子的结构数据。

 

除此之外，高性能计算在生命科学领域还可用于计算生物学、系统生物学、结构生物学、临床组学数据的分析存储、技术开发，辅助公卫中心进行病毒筛查、毒株分离、疫苗研发等工作。因此，市场前景十分广阔。

 

而随着高性能计算的发展，对于高性能计算的延伸与拓展的云计算的联系越来越紧密，云计算在性能及成本优势也越来越明显。近几年在阿里云、腾讯云、华为云等互联网大厂的主导之下，国内云计算市场也日趋成熟。北鲲云超算平台正是在这样的市场大背景下诞生的。

北鲲云超算平台一直致力于将云计算与科研相结合，并且取得了不错的成果。帮助高校生物信息组进行基因组分析，在一周内完成2000个物种基因组分析。大大提高了课题组的研究效率。在AlphaFold2问世后，北鲲云超算平台还部署了全球领先的Nvidia A100 和Nvidia V100 GPU卡，为运行AlphaFold2应用提供强劲的算力支持。

生命科学领域在云计算的加持下已经有了质的飞跃，云计算已经成为生命科学领域离不开的强力辅助。北鲲云超算平台不仅能够为科研人员提供算力资源，更重要的是能够为生命科学行业的企业用户提供一站式解决方案，将云计算拓展到更为注重计算精度的科研领域的同时，帮助生命科学行业的企业优化本地算力集群，加快企业的研发速度。这对于药企而言有着极为重要的价值。