2017年1月2日
摘要: 一 建立索引 比对之前,需要对fasta文件构建FM-index索引:bwa index -a bwtsw hg19.fasta 生成 hg19.fasta.amb、hg19.fasta.ann、hg19.fasta.bwt、hg19.fasta.pac、hg19.fasta.sa四个文件。 起可参 阅读全文
posted @ 2017-01-02 22:04 cjbourne 阅读(6833) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2016年12月11日
摘要: 红豆生南国是很遥远的事情 相思算什么,早无认在意 醉卧不夜城,处处霓虹 酒杯中还一片滥滥风情 最肯忘却古人诗,最不屑一顾是相思 守着爱怕人笑,还怕人看清 春又来看红豆开,竟不见有人去采 烟花拥着风流不在真情不在 最肯忘却古人诗,最不屑一顾是相思 守着爱怕人笑,还怕人看清 春又来看红豆开,竟不见有人去 阅读全文
posted @ 2016-12-11 17:06 cjbourne 阅读(120) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2016年3月19日
摘要: 数组的数组 哈希的哈希 阅读全文
posted @ 2016-03-19 09:26 cjbourne 阅读(143) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2016年3月18日
摘要: 注:这里用了一个thisfile来表示完整目录 转http://blog.csdn.net/zhoudaxia/article/details/4342316 阅读全文
posted @ 2016-03-18 11:25 cjbourne 阅读(134) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2015年9月15日
摘要: 在寻找k_word时,为了去打末尾的换行符,使用chomp;但 在windows下创建的的文件,读取一行,如一行为 weather 把它赋值为$str,然后print length($str),得到8;chomp $str; print length($str) 得到7 同样在linux创建同样的文 阅读全文
posted @ 2015-09-15 10:41 cjbourne 阅读(556) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2015年9月7日
摘要: Gpos 626维oA最大 Gneg 901 维最大 OA=0.9787 严格的分类 Gpos OA=0.9732 Gneg=0.9306 阅读全文
posted @ 2015-09-07 07:02 cjbourne 阅读(132) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2015年9月6日
摘要: Gpos Q8RP81 有GO:0000015 P47437 有GO:0000049 P06535 有GO:0000155 Q99027 有GO:0000160 P35594 有GO:0000166 ....... Q8NNK2 有GO:1902600 记为GO:0000001 GO:0000002 阅读全文
posted @ 2015-09-06 08:16 cjbourne 阅读(183) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2015年9月3日
摘要: 用你的手,剪我的剧,跌入这重播漩涡 千丈重播,万般折磨,追剧都不曾变过 一生追剧,一念失落,还执意一错再错, 一瞬之间,百兆流量,粉碎成末。爱上剧爱上了错,失了剧失了魂魄。可笑重播折磨,今生都无法逃脱 阅读全文
posted @ 2015-09-03 05:50 cjbourne 阅读(132) 评论(0) 推荐(0) 编辑
  2015年8月31日
摘要: 1) 若直接以20种氨基酸统计k_word: (以ZD98数据集为例) 维数太大不适用构造特征向量 考虑氨基酸约化后特征提取 约化方案: 约化后的特征 阅读全文
posted @ 2015-08-31 10:37 cjbourne 阅读(159) 评论(0) 推荐(0) 编辑