摘要：
给大家安利一款软件FORGE2，全称 Functional element Overlap analysis of the Results of GWAS Experiments version 2。简单来说，就是通过对 GWAS 信号位点和基因组功能调控元件进行富集，找到 GWAS 特异的细胞类型 阅读全文
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需求：提取 1 号染色体的 21856782-21856982 和 43942666-43942866 区间的 fa 序列； 需要准备的test.gff3文件如下所示，第一列是染色体号，第二列和第三列的内容随意，第四列和第五列是提取的开始位置和终止位置，第六列和第八列内容随意，第七列是基因组的正负链 阅读全文
摘要：
本周最新文献速递20211226 一、精细解读文献 一 文献题目： Finding genetically-supported drug targets for Parkinson’s disease using Mendelian randomization of the druggable ge 阅读全文
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本周最新文献速递20211219 一、精细解读文献 一 文献题目： The power of genetic diversity in genome-wide association studies of lipids 不想看英文题目： 脂质全基因组关联的遗传多样性研究 杂志和影响因子： Natur 阅读全文
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卡方检验（chi-square test）：独立性检验，判断变量之间是否有相关性； 费歇尔精确检验（fisher's exact test）：同样为独立性检验，但基于超几何分布； 什么情况下用卡方检验（chi-square test）或费歇尔精确检验（fisher's exact test）呢？ 以 阅读全文
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如下代码所示： data <- dat %>% arrange(desc(count)) #按照count一列降序排序 #data <- dat %>% arrange(count) #按照count一列升序排序 data$trait<-factor(data$trait,levels = uniq 阅读全文
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本周最新文献速递20211212 一、精细解读文献 一 文献题目： Common and rare variant association analyses in amyotrophic lateral sclerosis identify 15 risk loci with distinct ge 阅读全文
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如下图所示： 阅读全文
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现在有文件file.txt, 如下所示： header1 header2 chr10_10000018 chr11 chr10_10000018 chr12 chr10_100000625 chr10 chr10_100000645 chr11 chr10_100001867 chr11 可以看到， 阅读全文
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本周最新文献速递20211205 一、精细解读文献 一 文献题目： Large-scale integration of the plasma proteome with genetics and disease 不想看英文题目： 血浆蛋白质组、基因组、疾病的大规模整合分析 杂志和影响因子： Nat 阅读全文