摘要：
mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用：通过对多个表型相似的GWAS summary结果进行联合分析，发现更多的表型相关基因座。 以抑郁症状、神经质和主观幸福感这三个表型为例，分别对他们进行GWAS分析，鉴定得到32、9 和 13个基因座与它们相关。当将这三者进行 阅读全文
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报错原因：安装的libgfortran是3.0.0-1版本，但是调用libgfortran的软件需要的是1.0-0版本，因此重新安装即可：conda install libgfortran==1 阅读全文
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使用命令时出现报错： count3 = read.table("summary.txt",header=T,sep="\t") count3[is.na(count3)] <- "rs111" In `[<-.factor`(`*tmp*`, thisvar, value = "rs111") : 阅读全文
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For continuous traits, the effective sample size is the total sample size; For binary traits, the effective sample size is Ncase*Ncontrol/(Ncase+Ncont 阅读全文
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周末，参加了一场马拉松。 相较于上次，速度提升了一点，还是比较满意的，毕竟全程我都在压着心率跑。 奖牌长这样，挺丑的，其实~ 阅读全文
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1、scDRS的计算原理如下所示： 图片来源：Zhang M J, Hou K, Dey K K, et al. Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RN 阅读全文
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运行以下脚本时出现的报错IOError: Could not open Corces_ATAC_1000Gv3_ldscores/Corces_ATAC.1.1.l2.ldscore[./gz/bz2]： ldsc.py \ --h2-cts UKBB_BMI.sumstats.gz \ --ref 阅读全文
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LDSC 除了可以计算基因多效性、遗传度、遗传相关性,还可以计算不同的功能注释对表型的遗传度贡献，即 Partitioned Heritability 分析。下面具体讲讲怎么分析。 1 下载数据 wget -c https://storage.googleapis.com/broad-alkesgr 阅读全文
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使用以下命令时出现的报错： cellranger count --fastqs=${fastq_dir} \ --transcriptome=${ref_dir}/Human_index \ --localcores=30 \ --sample=file1,file2 \ --id=disease 阅读全文
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做GSEA分析的时候遇到的报错：GSEA analysis... Error in serialize(data, node$con) : error writing to connection 解决办法是重启RStudio :D 阅读全文