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摘要: 最近,看到Front. Genet.发了一篇文章“IntAssoPlot: An R Package for Integrated Visualization of Genome-Wide Association Study Results With Gene Structure and Linka 阅读全文
posted @ 2020-08-12 20:05 橙子牛奶糖 阅读(3507) 评论(5) 推荐(2) 编辑
摘要: 本周最新文献速递 一 文献题目: Korean Genome Project: 1094 Korean personal genomes with clinical information 不想看英文题目: 韩国基因组计划:拥有临床信息的1094个韩国个人基因组 杂志和影响因子: Sci Adv ( 阅读全文
posted @ 2020-08-09 14:15 橙子牛奶糖 阅读(353) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 介绍一个网站Genealogical Estimation of Variant Age (GEVA)。网址:https://human.genome.dating 看名字就知道这个网站是评估SNP位点突变年龄。 该网站是今年发表在PLoS biology的一篇文献“Dating genomic v 阅读全文
posted @ 2020-08-08 16:08 橙子牛奶糖 阅读(624) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 本周最新文献速递 一 文献题目: Testing and controlling for horizontal pleiotropy with probabilistic Mendelian randomization in transcriptome-wide association studie 阅读全文
posted @ 2020-08-02 15:21 橙子牛奶糖 阅读(272) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 很多人问过我敏感性分析的问题,说明大家对敏感性分析普遍是有疑问的,我之前的推文中也没有详细的讲过,因此决定写这一篇补充一下敏感性分析的工作。 什么是敏感性分析 敏感性分析定义:敏感度分析是研究数学模型或系统(数值或其他)输出中的不确定性如何在其输入中被分配到不同的不确定性来源 ——摘自维基百科。 我 阅读全文
posted @ 2020-07-30 16:21 橙子牛奶糖 阅读(15185) 评论(2) 推荐(1) 编辑
摘要: 本周最新文献速递 一 文献题目: Multi-faceted epigenetic dysregulation of gene expression promotes esophageal squamous cell carcinoma 不想看英文题目: 基因表达的多方面表观遗传失调促进食管鳞状细胞 阅读全文
posted @ 2020-07-24 23:34 橙子牛奶糖 阅读(324) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 本周最新文献速递 一 (将不完全相似的表型进行荟萃分析,找出新的遗传位点,这是我第二次见到文献进行这种操作,一个新思路,值得借鉴) 文献题目: Multivariate genomic scan implicates novel loci and haem metabolism in human a 阅读全文
posted @ 2020-07-19 15:11 橙子牛奶糖 阅读(548) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: file1的文件如下所示: a rs1 b rs2 c rs4 file2的文件如下所示: a 0.170721 -1.82031 0.0690841 rs1 b 0.0803412 -1.01669 0.309605 rs2 c 0.21245 0.22964 0.81843 rs3 d 0.07 阅读全文
posted @ 2020-07-17 09:48 橙子牛奶糖 阅读(646) 评论(2) 推荐(1) 编辑
摘要: 本周最新文献速递 一 文献题目: Multi-method Genome- And Epigenome-Wide Studies of Inflammatory Protein Levels in Healthy Older Adults 不想看英文题目: 健康老年人炎症蛋白水平的全基因组和表观基因 阅读全文
posted @ 2020-07-12 20:26 橙子牛奶糖 阅读(422) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: MR-PRESSO是18年发在Nature Genetics上的一个检验水平基因多效性的方法Detection of widespread horizontal pleiotropy in causal relationships inferred from Mendelian randomizat 阅读全文
posted @ 2020-07-11 14:48 橙子牛奶糖 阅读(11533) 评论(2) 推荐(1) 编辑
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