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前段时间毕业论文盲审，有一位盲审老师提的意见是到EnhancerDB网站看一下SNP上是否有增强子、如果有的话再看一下所在的增强子调控的靶基因是否为感兴趣的基因（真优秀，就喜欢这种直接提供干货的老师）。 于是我搜了一下EnhancerDB，看到底干嘛用的。 EnhancerDB全称是A web da 阅读全文
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今天博主博士答辩完毕啦，超开心的，撒花~ 虽然很疲惫（昨晚太晚睡了==），但想到今天跟师妹说给她gene-based关联分析的方法。 于是，决定还是整理好了再休息休息。 好，进入主题。 之前的推文我曾经写过使用VEGAS2（Versatile Gene-based Association Study 阅读全文
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本周最新文献速递 一 文献题目： Prediction of Alzheimer's disease using multi-variants from a Chinese genome-wide association study 不想看英文题目： 使用多个变异预测阿尔茨海默病 杂志和影响因子： 阅读全文
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看文献的时候，发现了g:Profiler这个宝藏工具，测试了一下，使用起来超级方便、好用，一定要分享给大家~ g:Profiler网址： https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/ 下面具体讲一下该网站的功能。 1、GO 功能富集分析 功能富集分析包括：Gene ontolog 阅读全文
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本周最新文献速递 一 文献题目： Degenerative and regenerative pathways underlying Duchenne muscular dystrophy revealed by single-nucleus RNA sequencing 不想看英文题目： 单核RN 阅读全文
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本周最新文献速递 一 文献题目： snRNA-seq reveals a subpopulation of adipocytes that regulates thermogenesis 不想看英文题目： snRNA-seq揭示脂肪细胞亚群的产热机制 杂志和影响因子： Nature（42.778 1 阅读全文
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一 文献题目： A genome-wide association study of severe asthma exacerbations in Latino children and adolescents 不想看英文题目： 拉丁裔儿童和青少年急性哮喘发作的全基因组关联研究 杂志和影响因子： E 阅读全文
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遗传相关的计算之前介绍过几次了，感兴趣的翻之前的推文： 1、利用GCTA工具计算复杂性状/特征（Complex Trait）的遗传相关性（genetic correlation） 2、LD SCore计算基因多效性、遗传度、遗传相关性 之前的两篇推文均有一个小局限，就是针对多个表型间的遗传相关性计算 阅读全文
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本周最新文献速递 今天有点忙，但文献分享不能落下，因此先介绍两篇吧。 一、不显著，也可以在高分杂志讲故事 文献题目： Genetic Regulation of Atherosclerosis-Relevant Phenotypes in Human Vascular Smooth Muscle C 阅读全文
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传统的全基因组关联分析（GWAS）计算的是单个SNP与表型的相关性，除此之外，我们还可以进行SNP之间的互作效应与表型的相关性分析。 本推文主要介绍的是SNP间的上位效应与表型的相关性分析。 上位效应的公式为：Y ~ b0 + b1.A + b2.B + b3.AB + e Y为表型，A和B分别为两 阅读全文