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现在有文件sed.txt如下所示： 可以看到该文件的列数是不相同的，我想找到第11列到最后一列不等于0的列（红色部分），且显示列数和数值，则用命令： awk '{for(i=11;i<=NF;i++) if($i != 0) print $i,i}' sed.txt 效果如下： 阅读全文
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跑命令bedtools genomecov -ibam file.bam -bga -split -trackline > file.wig时出现的报错。 解决方案： samtools sort file.bam -T /tmep -o file.sorted.bam #/tmep指的是新建一个tm 阅读全文
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monozygotic (MZ) twins 单卵(同卵)孪生 dizygotic (DZ) twins 异卵双生 阅读全文
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本周最新文献速递20210606 一 文献题目： A map of transcriptional heterogeneity and regulatory variation in human microglia 不想看英文题目： 人类小胶质细胞的转录异质性和调控变异图谱 杂志和影响因子： Nat 阅读全文
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这些年，陆陆续续收到不少小伙伴问我怎么在文章中致谢我，给个统一模板： We thank the blogger (orange_milk_sugar, Wenyan Chen) for XXX XXX 部分请自由发挥。 阅读全文
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1. 人类基因组转录起始位点 TSS http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/current/human/refTSS_v3.1_human_coordinate.hg38.bed.gz http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/ 阅读全文
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给大家推荐一个基因-药物相互作用数据库 DGIdb (网址：https://www.dgidb.org/) 该网站主要有两个功能： 1）可通过输入基因查找相互作用的药物； 2）通过输入药物查找相互作用的基因。 1、通过基因查找相互作用的药物 使用起来非常简单，只要输入基因名，就可以得到与基因相互作用 阅读全文
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本周末博主要找房子和搬家，故提前发本周的文献速递推文； 一 文献题目： Interpreting type 1 diabetes risk with genetics and single-cell epigenomics 不想看英文题目： 利用遗传学和单细胞表观基因组学解析1型糖尿病的风险 杂志和 阅读全文
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跑metaxcan时遇到报错提示：AttributeError: Can only use .str accessor with string values! 仔细排查，发现是输入文件分隔符的问题。 我的输入文件分隔符是空白分隔符，而metaxcan要求输入文件分隔符必须是tab 因此，重新生成输出 阅读全文
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本周最新文献速递20210516 一 文献题目： Landscape of allele-specific transcription factor binding in the human genome 不想看英文题目： 人类基因组中等位基因特异性转录因子结合图谱 杂志和影响因子： Nat Com 阅读全文