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摘要: 本周最新文献速递20210725 一、精细解读文献 一 文献题目: Distinction between the effects of parental and fetal genomes on fetal growth 不想看英文题目: 亲本和胎儿基因组对胎儿生长影响的迥异 杂志和影响因子: N 阅读全文
posted @ 2021-07-25 22:45 橙子牛奶糖 阅读(375) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 安装BiocManager::install("org.Hs.eg.db")时出现的报错。 解决方案:重新安装Rcpp即可: install.packages("Rcpp") BiocManager::install("org.Hs.eg.db") 阅读全文
posted @ 2021-07-24 17:36 橙子牛奶糖 阅读(9158) 评论(0) 推荐(2) 编辑
摘要: GWAS找到显著信号位点后,需要解释显著信号位点如何影响表型。 常见的一个解释方法是共定位分析。 主流的共定位分析包括: 1)GWAS和eQTL共定位; 2)GWAS和sQTL共定位; 3)GWAS和meQTL共定位; 4)GWAS和pQTL共定位; 其中,GWAS和eQTL共定位应用最为广泛。 具 阅读全文
posted @ 2021-07-23 20:03 橙子牛奶糖 阅读(5239) 评论(1) 推荐(1) 编辑
摘要: 跑以下命令时: bcftools view -S samplelistname.txt file.vcf.gz -Ov > newfile.vcf 产生报错:[E::vcf_parse_format] Number of columns at chrX:XX does not match the n 阅读全文
posted @ 2021-07-21 22:27 橙子牛奶糖 阅读(491) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 错误示例和对应的报错: printf "#!/bin/bash \n #PBS -N step7-rsem-calculate-expression1 \n" !/bin/bash: event not found 正确示例: printf '#!/bin/bash \n#PBS -N step7- 阅读全文
posted @ 2021-07-19 20:57 橙子牛奶糖 阅读(170) 评论(2) 推荐(1) 编辑
摘要: 一、深圳湾实验室简介 深圳湾实验室(生命信息与生物医药广东省实验室 https://www.szbl.ac.cn),由深圳市承建,深圳市科创委和北京大学深圳研究生院共同举办,协同深圳大学、南方科技大学、香港中文大学(深圳)、清华大学深圳研究生院、哈尔滨工业大学(深圳)、中科院深圳先进技术研究院、华大 阅读全文
posted @ 2021-07-19 20:17 橙子牛奶糖 阅读(252) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 跑以下命令时出现的报错:two mates are aligned to two different transcripts!…… failed! Plase check if you provide correct parameters/options for the pipeline while 阅读全文
posted @ 2021-07-19 20:16 橙子牛奶糖 阅读(279) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 本周最新文献速递20210718 一、精细解读文献 一 文献题目: Tissue-specific 5-hydroxymethylcytosine landscape of the human genome 不想看英文题目: 人类基因组的组织特异性 5-羟甲基胞嘧啶景观 杂志和影响因子: Nat C 阅读全文
posted @ 2021-07-18 20:54 橙子牛奶糖 阅读(177) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 使用超算本地安装conda install --use-local bioconductor-genomeinfodbdata-1.2.0-r351_0.tar.bz2出现的报错。 主要原因是超算不允许链接外网,而安装该包时会下载其他的数据,故出现报错。 所以只需要把genomeinfodbdata 阅读全文
posted @ 2021-07-17 18:08 橙子牛奶糖 阅读(626) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 使用命令conda install --use-local r-processx-3.5.2-r36h2be38b1_0.tar.bz2出现的报错, 改为conda install --use-local r-processx-3.5.2-r36hcfec24a_0.tar.bz2即可。 猜测下载的 阅读全文
posted @ 2021-07-17 17:57 橙子牛奶糖 阅读(576) 评论(0) 推荐(1) 编辑
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