橙子牛奶糖

摘要： 深圳湾实验室系统与物理生物学研究所化学蛋白质组学课题组招聘公告 一、深圳湾实验室简介 深圳湾实验室（生命信息与生物医药广东省实验室）是广东省、深圳市建设粤港澳国际科技创新中心和综合性国家科学中心的重大战略部署，是深圳建设中国特色社会主义先行示范区行动中，全力支持的重大创新载体。 深圳湾实验室面向世界 阅读全文

摘要： 使用以下命令时产生报错： /Salmon-0.8.1_linux_x86_64/bin/salmon quant -i /ref/salmon/ --libType A -r /human/file.fq -o /salmon-quant/ 报错内容为： ESC[00mException : [ra 阅读全文

摘要： 今天使用单端测序的 bam 文件进行表达值calling，命令如下所示： rsem-calculate-expression \ --alignments \ -p 8 \ file.sorted.bam \ /reference/rsem_ref/GRCh37/GRCh37 \ file 报错内容 阅读全文

摘要： 本周最新文献速递20210925 一、精细解读文献 一 文献题目： Protein-coding repeat polymorphisms strongly shape diverse human phenotypes 不想看英文题目： 蛋白质编码重复多态性强烈改变人类不同表型 杂志和影响因子： S 阅读全文

摘要： 文件mart_export.txt3如下所示，可以看到，ENSG00000002016的第二列有很多不同的内容： 现在想要把相同ID的行进行合并，生成新的文件mart_export.txt4如下所示： 则可以使用命令： phe = read.table("mart_export.txt3",head 阅读全文

摘要： 现有文件mart_export.txt（如下图所示），其第三列存在空格： 现在想把第三列为空格的行去除掉，则可以使用命令： cat mart_export.txt |awk '{if($3!="")print $0}' > mart_export.txt1 新的文件mart_export.txt1如 阅读全文

摘要： 如下图所示，我想对V5这列进行计数。 对于mutate函数，命令如下所示： need1= phe %>% group_by(V5) %>% mutate(count=n()) 得到的结果如下所示： 对于count函数，命令如下所示： need1= phe %>% count(V5, sort = T 阅读全文

摘要： 现有文件如下所示： 可以看到，有多个列，现在我想把多个列转为多个行的格式，效果如下所示： 则可以使用命令：awk '/GTEX/{for(i=1;i<=NF;i++) print $i}' file 阅读全文

摘要： NamiRNA属于miRNA。 在转录过程中通过与 3ʹ 或 5ʹ 非翻译区（3ʹ 或 5ʹ UTR）、启动子和增强子区域的碱基配对，激活靶基因。 在哺乳动物中，miRNAs/NamiRNAs 控制着一半以上的蛋白质编码基因。 来源：https://cmbl.biomedcentral.com/ar 阅读全文

摘要： file.txt如下所示： phe rs1 rs2 9 AG AA 6 GG CA 4 GG AA 1、如果想提取rs1列中含有GG的行，则可以使用命令： phe = read.table("file.txt",header=T,check.names=F) phe1=phe %>% filter( 阅读全文