07 2023 档案

linux: 去除重复行，且保留原来的行排序
摘要：linux 用sort+uniq虽然可以去重，但是会改动原文件行的顺序。 因此可以用`awk '!x[0]++′file.txt>sort.txt‘命令‘′!x[0]++'`可以在去重的基础上，不改动原来文件的行顺序。 阅读全文
posted @ 2023-07-21 18:30 橙子牛奶糖 阅读(398) 评论(0) 推荐(1) 编辑
cuffmerge报错解决方案：run_log = open(logging_dir + "run.log", "w", 0)， ValueError: can't have unbuffered text I/O
摘要：运行命令`src/cuffmerge−o./merge−g{input}/gencode.v44.primary_assembly.annotation_sorted.gtf merge.list`时报错： >run_log = open(logging_dir + "run.log 阅读全文
posted @ 2023-07-21 14:55 橙子牛奶糖 阅读(145) 评论(0) 推荐(0) 编辑
CpG islands (CGI), CpG Shores, CpG Shelves, Open sea in DNA methylation
摘要：![](https://img2023.cnblogs.com/blog/812148/202307/812148-20230712154631880-306639785.png =500x) >https://life-epigenetics-methylprep.readthedocs-host 阅读全文
posted @ 2023-07-12 18:49 橙子牛奶糖 阅读(177) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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