02 2023 档案

R语言：ggplot2变量去除双引号
摘要：在ggplot2中需要对列名为CWY的变量进行画图，但是CWY是一个字符串，如下所示： colnames(all)[1] [1] "CWY" 因此如果用以下命令出现报错： ggplot(all,aes(colnames(all)[1],colnames(all)[2]))+ stat_boxplot 阅读全文
posted @ 2023-02-21 15:19 橙子牛奶糖 阅读(250) 评论(0) 推荐(0) 编辑
R语言：wilcox_test 出现报错 Can't extract columns that don't exist. x Column doesn't exist.
摘要：运行以下命令时： stat.test <- all %>% wilcox_test(colnames(all)[1] ~ colnames(all)[2]) %>% adjust_pvalue(method ="BH") %>% add_significance("p.adj") stat.test 阅读全文
posted @ 2023-02-21 14:29 橙子牛奶糖 阅读(265) 评论(0) 推荐(0) 编辑
liftOver报错：Deleted in new
摘要：使用命令bin/liftOver{data}/hg19.bed bin/hg19ToHg38.over.chain.gz{data}/hg38.bed ${data}/hg38Unmap.bed对基因组坐标进行位置转换时，发现全部是Deleted in new的报错。 报错如下所 阅读全文
posted @ 2023-02-20 21:05 橙子牛奶糖 阅读(112) 评论(0) 推荐(0) 编辑
GWAS：mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS) 分析
摘要：mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用：通过对多个表型相似的GWAS summary结果进行联合分析，发现更多的表型相关基因座。 以抑郁症状、神经质和主观幸福感这三个表型为例，分别对他们进行GWAS分析，鉴定得到32、9 和 13个基因座与它们相关。当将这三者进行 阅读全文
posted @ 2023-02-14 21:28 橙子牛奶糖 阅读(1201) 评论(0) 推荐(0) 编辑
报错：ImportError: libgfortran.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory
摘要：报错原因：安装的libgfortran是3.0.0-1版本，但是调用libgfortran的软件需要的是1.0-0版本，因此重新安装即可：conda install libgfortran==1 阅读全文
posted @ 2023-02-03 20:20 橙子牛奶糖 阅读(264) 评论(0) 推荐(1) 编辑

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