12 2022 档案

周末，参加了一场马拉松
摘要：周末，参加了一场马拉松。 相较于上次，速度提升了一点，还是比较满意的，毕竟全程我都在压着心率跑。 奖牌长这样，挺丑的，其实~ 阅读全文
posted @ 2022-12-19 18:40 橙子牛奶糖 阅读(158) 评论(1) 推荐(0) 编辑
Post-GWAS: single-cell disease relevance score (scDRS) 分析
摘要：1、scDRS的计算原理如下所示： 图片来源：Zhang M J, Hou K, Dey K K, et al. Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RN 阅读全文
posted @ 2022-12-15 21:03 橙子牛奶糖 阅读(647) 评论(0) 推荐(0) 编辑
LDSC: Could not open Corces_ATAC_1000Gv3_ldscores/Corces_ATAC.1.1.l2.ldscore[./gz/bz2]
摘要：运行以下脚本时出现的报错IOError: Could not open Corces_ATAC_1000Gv3_ldscores/Corces_ATAC.1.1.l2.ldscore[./gz/bz2]： ldsc.py \ --h2-cts UKBB_BMI.sumstats.gz \ --ref 阅读全文
posted @ 2022-12-03 17:52 橙子牛奶糖 阅读(236) 评论(0) 推荐(0) 编辑
Post-GWAS: Partitioned Heritability 分析
摘要：LDSC 除了可以计算基因多效性、遗传度、遗传相关性,还可以计算不同的功能注释对表型的遗传度贡献，即 Partitioned Heritability 分析。下面具体讲讲怎么分析。 1 下载数据 wget -c https://storage.googleapis.com/broad-alkesgr 阅读全文
posted @ 2022-12-02 21:33 橙子牛奶糖 阅读(992) 评论(2) 推荐(0) 编辑

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