07 2022 档案

Rstudio: cannot create dir, reason 'No such file or directory'
摘要：使用 Rstudio 安装 R 包install.packages("ggsignif")时弹出的错误。 解决办法：改成在 R 下安装就可解决，注意不是在 Rstudio 界面。 阅读全文
posted @ 2022-07-21 21:40 橙子牛奶糖 阅读(454) 评论(0) 推荐(0) 编辑
Cytoscape: 富集分析通路显示基因名（CluePedia+ClueGO）
摘要：分别添加完 CluePedia 和 ClueGO 插件后，输入基因名，按照如下顺序即可显示通路中的基因名。 阅读全文
posted @ 2022-07-11 15:44 橙子牛奶糖 阅读(1061) 评论(0) 推荐(0) 编辑
403. That’s an error. Your client does not have permission to get URL
摘要：解决方案： 1、换个IP地址； 2、换个URL地址； 比如原先是https://www.google.com，改成https://www.google.com.hk/?gws_rd=ssl 阅读全文
posted @ 2022-07-07 22:14 橙子牛奶糖 阅读(3637) 评论(0) 推荐(0) 编辑
gffread: 从基因组提取fa
摘要：使用命令gffread -w test.fa -g GRCh38.primary_assembly.genome.fa test.gff3即可实现。 输入文件test.gff3如下所示： 记住：第三类可以写：transcript, protein, cds。不能写其他的字符，不然提取不了。 得到的输 阅读全文
posted @ 2022-07-04 12:14 橙子牛奶糖 阅读(334) 评论(0) 推荐(0) 编辑
R语言：按分隔符分割字符串并提取倒数三列
摘要：数据框如下所示： 现在我们希望分割成如下格式： 则需要用到代码： library(stringi) test=read.table('test.file', header=F,sep=' ') y1=lapply(stri_split_regex(stri_reverse(test$new), pa 阅读全文
posted @ 2022-07-01 14:29 橙子牛奶糖 阅读(720) 评论(0) 推荐(0) 编辑

点击右上角即可分享
微信分享提示