07 2021 档案
摘要：我不知道导致这个报错的原因是什么。 但我通过重新安装boost解决了这个问题。 wget https://boostorg.jfrog.io/artifactory/main/beta/1.77.0.beta1/source/boost_1_77_0_b1.tar.gz tar -zxvf boos
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摘要：原始文件mir.txt如下所示： 现在我想把末尾这些长短不一的字母都去掉，可以用命令：sed -r 's/[A-Z]{1,10}指的是处理末尾1-10个不等的字母； mir1.txt的效果如下所示：
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摘要：1、安装"biomaRt"包 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("biomaRt") library("biomaRt"
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摘要：报错： Error in UseMethod("filter_") : "filter_"没有适用于"c('tbl_SQLiteConnection', 'tbl_dbi', 'tbl_sql', 'tbl_lazy', 'tbl')"目标对象的方法 Error in UseMethod("filt
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摘要：解决方案： 卸载“stringi”包，我是直接选择删除整个包； 重新安装“stringi”包：install.packages("stringi")
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摘要：使用坐标转换时出现的报错：Expecting integer field 7 line 1 of ../trash/hglft_genome_60165_e07ed0.user, got 1.0 报错原因： 第七列存在问题； 由于我只需要用到前三列，因此重新提取前三列进行转换就OK了。
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摘要：使用以下方式进行坐标转换时出现报错：Chain mapping error: chr1:205978511-205978511 把坐标改成0-based的格式就行了，如下所示：
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摘要：本周最新文献速递20210725 一、精细解读文献 一 文献题目： Distinction between the effects of parental and fetal genomes on fetal growth 不想看英文题目： 亲本和胎儿基因组对胎儿生长影响的迥异 杂志和影响因子： N
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摘要：安装BiocManager::install("org.Hs.eg.db")时出现的报错。 解决方案：重新安装Rcpp即可： install.packages("Rcpp") BiocManager::install("org.Hs.eg.db")
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摘要：GWAS找到显著信号位点后，需要解释显著信号位点如何影响表型。 常见的一个解释方法是共定位分析。 主流的共定位分析包括： 1）GWAS和eQTL共定位； 2）GWAS和sQTL共定位； 3）GWAS和meQTL共定位； 4）GWAS和pQTL共定位； 其中，GWAS和eQTL共定位应用最为广泛。 具
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摘要：跑以下命令时： bcftools view -S samplelistname.txt file.vcf.gz -Ov > newfile.vcf 产生报错：[E::vcf_parse_format] Number of columns at chrX:XX does not match the n
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摘要：错误示例和对应的报错： printf "#!/bin/bash \n #PBS -N step7-rsem-calculate-expression1 \n" !/bin/bash: event not found 正确示例： printf '#!/bin/bash \n#PBS -N step7-
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摘要：一、深圳湾实验室简介 深圳湾实验室（生命信息与生物医药广东省实验室 https://www.szbl.ac.cn），由深圳市承建，深圳市科创委和北京大学深圳研究生院共同举办，协同深圳大学、南方科技大学、香港中文大学（深圳）、清华大学深圳研究生院、哈尔滨工业大学（深圳）、中科院深圳先进技术研究院、华大
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摘要：跑以下命令时出现的报错：two mates are aligned to two different transcripts!…… failed! Plase check if you provide correct parameters/options for the pipeline while
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摘要：本周最新文献速递20210718 一、精细解读文献 一 文献题目： Tissue-specific 5-hydroxymethylcytosine landscape of the human genome 不想看英文题目： 人类基因组的组织特异性 5-羟甲基胞嘧啶景观 杂志和影响因子： Nat C
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摘要：使用超算本地安装conda install --use-local bioconductor-genomeinfodbdata-1.2.0-r351_0.tar.bz2出现的报错。 主要原因是超算不允许链接外网，而安装该包时会下载其他的数据，故出现报错。 所以只需要把genomeinfodbdata
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摘要：使用命令conda install --use-local r-processx-3.5.2-r36h2be38b1_0.tar.bz2出现的报错， 改为conda install --use-local r-processx-3.5.2-r36hcfec24a_0.tar.bz2即可。 猜测下载的
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摘要：本周最新文献速递20210711 一、精细解读文献 一 文献题目： BANP opens chromatin and activates CpG-island-regulated genes 不想看英文题目： BANP 打开染色质并激活 CpG 岛调控基因 杂志和影响因子： Nature (IF:
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摘要：方法一： pip install XXX.tar.gz 方法二： pip install XXX.whl
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摘要：跑命令时python mountainClimberTU.py -b file.bedgraph -j SRRT.bed -s 0 -g hg38.chrom.sizes -o SRR950078_tu.bed 时出现报错: Error: Sorted input specified, but th
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摘要：使用conda install sklearn命令安装sklearn出现了报错：Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve. 换成pip install sklearn即可成功
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摘要：本周最新文献速递20210704 一、精细解读文献 一 文献题目： Genetic drivers of m6A methylation in human brain, lung, heart and muscle 不想看英文题目： 人脑、肺、心脏和肌肉中 m6A 甲基化的遗传驱动因素研究 杂志和影
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