摘要: 对GWAS的summary文件进行整合时,经常需要在beta,or, se, p, zscore之间进行换算,故在此总结一下​。希望对大家有帮助。 1. se 计算 1.1 有 beta、p ,计算se; se=sqrt(((beta)^2)/qchisq(p,1,lower.tail=F)) 1. 阅读全文
posted @ 2021-03-04 22:52 橙子牛奶糖 阅读(34093) 评论(5) 推荐(3) 编辑
摘要: 1. 有 beta、p ,计算se; 公式为:se=sqrt(((beta)^2)/qchisq(p,1,lower.tail=F)) 2. 有 or、p ,计算se; 公式为:se=abs(log(or)/qnorm(p/2)) 此外, beta等同于log(or); qnorm(1-p/2)等同 阅读全文
posted @ 2021-03-04 15:34 橙子牛奶糖 阅读(4490) 评论(0) 推荐(1) 编辑