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橙子牛奶糖
简介:陈文燕,本科暨南大学,中科院博士。 欢迎关注微信公众号“bio生物信息”,进群与众多生信同行一起讨论学术问题。私信不回,有问题请在文章下面评论。
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2021年1月28日
shell实现碱基/氨基酸序列提取(sed,grep,awk三大利器走向天下)
摘要: 假定存在file.fa文件,其序列如下所示: 现在有四个任务,分别如下所示: 任务一:提取包含“RBFOX1”字符的序列 第一步:sed -i '/>/i\@' file.fa file.fa指的是包含所有序列的文件;这一步的意思是在以">"开头的字符串前一行加上"@",方便后续序列的识别和匹配;
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posted @ 2021-01-28 20:10 橙子牛奶糖
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